病假请三个月后不辞职，并不意味着自动离职或劳动合同自动终止，具体处理方式需结合公司规章制度、劳动合同约定及法律规定来综合判断。以下是对此问题的详细分析：

1. 法律规定层面：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关规定，员工因病或非因工负伤需要停止工作医疗时，享有医疗期。医疗期的具体长度根据员工的实际工作年限和在本单位的工作年限确定，范围从三个月到二十四个月不等。在医疗期内，用人单位不得随意解除劳动合同，除非存在法律规定的特定情形（如严重违反用人单位的规章制度等）。
   • 因此，病假三个月后，如果仍在医疗期内，用人单位不得解除劳动合同，员工也不构成自动离职。

2. 合同约定层面：

   • 劳动合同中可能包含关于病假的具体条款，包括医疗期的长度、病假期间的待遇以及超过医疗期后的处理方式等。这些条款应在签订劳动合同时由双方明确约定。
   • 如果劳动合同中明确规定了病假超过一定期限的处理方式（如调整工作岗位、降低薪资等），且该规定不违反法律法规的强制性规定，那么双方应按照合同约定执行。

3. 公司规章制度层面：

   • 用人单位通常会有自己的规章制度，其中可能包含关于病假的规定。这些规定应合法合规，并提前告知员工。
   • 如果公司的规章制度明确规定了病假超过一定期限视为自动离职，且该规定不违反法律法规的强制性规定，那么员工在病假超过该期限后，理论上可能会被视为自动离职。但这种情况较为少见，且需确保规章制度的制定程序合法、内容合理，并经过民主程序制定且公示或告知劳动者。更重要的是，即便规章制度有此规定，若与法律强制性规定相冲突，该规定也是无效的。

4. 实际情况分析：

   • 医疗期内的保护：员工在医疗期内享有法律保护，用人单位不得因员工请病假而解除劳动合同。医疗期满后的处理需依据法律规定和公司规章制度进行，不能简单地以病假超过三个月为由视为自动离职。
   • 沟通与协商：当员工病假时间较长时，用人单位应与员工进行积极沟通，了解病情和治疗进展。双方可以协商调整工作岗位、工作内容或工作时间等，以适应员工的身体状况。
   • 解除合同的法定程序：如果用人单位认为员工已无法继续履行劳动合同，且符合法律规定的解除合同条件（如医疗期满后不能从事原工作也不能从事由用人单位另行安排的工作），应按照法定程序与员工解除劳动合同，并支付相应的经济补偿金。

建议：

• 对于员工而言，如果病假时间较长，建议及时与用人单位沟通，了解公司的规章制度和劳动合同中的相关条款，以便做好后续安排。
• 对于用人单位而言，应依法制定规章制度，并提前告知员工。在处理员工病假问题时，应遵循法律规定和合同约定，积极与员工沟通协商，避免引发劳动争议。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。