在公司不配合工伤认定的情况下，职工不能直接提起诉讼，而应当首先通过行政程序进行工伤认定，随后再根据认定结果选择适当的法律途径维权。具体分析如下：

1. 工伤认定的申请：

   • 根据《工伤保险条例》和相关规定，职工在事故伤害发生或被诊断、鉴定为职业病之日起1年内，可以直接向用人单位所在地统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。
   • 申请时需准备劳动关系证明材料（如劳动合同、工资发放记录等）、医疗机构诊断证明等相关资料。

2. 行政途径的优先性：

   • 工伤认定是劳动行政部门根据法律授权，对职工因事故伤害或患职业病是否属于工伤进行定性的行政确认行为。
   • 完成工伤认定是后续维权的关键，因为它是整个工伤赔偿流程的前置程序。只有完成这一步，才能进入后续的劳动仲裁或民事诉讼程序来主张工伤赔偿。

3. 后续的法律途径：

   • 如果公司对工伤认定结论不服，可以依法申请行政复议或提起行政诉讼。
   • 如果公司不配合工伤认定，且在行政途径无法解决问题时，职工可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求公司承担相应的赔偿责任。
   • 在极端情况下，如果仲裁结果仍不满意，职工可以依法向人民法院提起诉讼。

综上所述，面对公司不配合工伤认定的情况，职工应当首先通过行政程序申请工伤认定，并根据认定结果选择适当的法律途径进行维权。直接提起诉讼通常不是首选途径，因为法院通常不会受理未经工伤认定的工伤赔偿案件。如果你在这个过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。