医院亏损扣员工工资是否犯法，不能一概而论，需要分情况讨论：

1. 若劳动合同或规章制度中有明确约定：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位与劳动者应当遵循合法、公平、平等自愿、协商一致的原则订立劳动合同。如果劳动合同中明确约定了医院在亏损情况下可以扣减员工工资，且该约定不违反法律、行政法规的强制性规定，也不违背公序良俗，那么这种扣减行为可能是合法的。但需要注意的是，即使劳动合同中有这样的约定，扣减的幅度和方式也必须合理，不能损害劳动者的基本生活权益。
   • 另外，如果医院的规章制度中也有类似的规定，并且该规章制度已经经过职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定，且不违反法律、行政法规的强制性规定，那么这种扣减行为也可能是合法的。

2. 若劳动合同或规章制度中无明确约定：

   • 在没有明确约定的情况下，医院因亏损而扣减员工工资的行为可能构成违法。因为根据《中华人民共和国劳动法》的规定，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。医院亏损并不是克扣或拖欠工资的合法理由。
   • 如果医院确实因为经营困难需要调整工资结构或扣减部分工资，应当与劳动者进行协商，并达成一致意见。如果协商不成，医院不能单方面扣减工资，否则可能面临劳动争议和法律责任。

法律建议：

• 对于劳动者而言，如果医院因亏损而扣减工资，首先应当查看自己的劳动合同和医院的规章制度，了解是否有相关的约定。如果没有约定或者约定不明确，可以与医院进行协商，要求医院按照法律规定支付工资。如果协商不成，可以向当地的劳动监察部门投诉或者申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
• 对于医院而言，如果确实因为经营困难需要调整工资结构或扣减部分工资，应当提前与劳动者进行协商，并达成一致意见。同时，医院也应当加强内部管理，提高经营效率，努力改善经营状况，避免因为亏损而损害劳动者的权益。

可能法律后果：

• 如果医院违法扣减工资，可能面临劳动监察部门的处罚，包括责令限期支付劳动报酬、加付赔偿金等。
• 同时，劳动者也有权向法院提起诉讼，要求医院支付被扣减的工资及相应的经济补偿。

总结：医院亏损扣员工工资是否犯法，取决于劳动合同或规章制度中是否有明确约定以及扣减的幅度和方式是否合理。在没有明确约定或扣减不合理的情况下，医院的行为可能构成违法。因此，建议医院和劳动者在处理此类问题时，应当遵循法律规定，通过协商达成一致意见，以维护双方的合法权益。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。