员工申请劳动仲裁，工商局一般不会直接来公司。以下是详细解释：

1. 劳动仲裁与工商局的职责区分：

   • 劳动仲裁是处理劳动争议的一种法律程序，主要由劳动争议仲裁委员会负责。当员工与公司之间发生劳动争议，如工资支付、工伤赔偿、解除劳动合同等问题时，员工可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
   • 工商局（现市场监督管理局）主要负责市场监管、企业登记注册、商标注册、反垄断与反不正当竞争等行政职能，并不直接参与劳动争议的处理。

2. 劳动仲裁的流程：

   • 员工申请劳动仲裁后，劳动争议仲裁委员会会受理案件，并通知双方当事人参加仲裁庭审。
   • 仲裁庭审过程中，双方当事人会提交证据、陈述事实和理由，仲裁员会根据双方提供的证据和法律规定进行裁决。
   • 裁决结果出来后，如果一方不履行裁决，另一方可以向人民法院申请强制执行。

3. 工商局可能介入的情况：

   • 虽然工商局不直接参与劳动争议的处理，但在某些特定情况下，如公司存在违法经营、未依法为员工缴纳社会保险等违法行为时，工商局（或市场监督管理局）可能会根据相关法律法规对公司进行行政处罚或调查。
   • 然而，这种情况下的介入与劳动仲裁是两个独立的法律程序，工商局不会因为员工申请了劳动仲裁而直接来公司。

4. 建议：

   • 如果员工与公司之间发生劳动争议，建议员工首先与公司协商解决；协商不成的，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
   • 在申请仲裁前，员工应收集好相关证据，如劳动合同、工资单、工作证等，以便在仲裁庭审中证明自己的主张。
   • 如果员工对仲裁结果不满意，还可以在法定期限内向人民法院提起诉讼。

综上所述，员工申请劳动仲裁并不会导致工商局直接来公司。劳动争议应通过劳动争议仲裁委员会或人民法院等法律程序来解决。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。