结论：工资1990元，但缴费基数是4000元，这一做法是否合法，需分情况讨论，一般情况下若该缴费基数不低于当地规定的最低缴费基数，且用人单位与劳动者协商一致或符合行业惯例等，则可能是合法的；但若低于当地最低缴费基数或未经合法程序确定，则不合法。以下为详细分析：

一、缴费基数的确定原则

根据《社会保险法》及相关规定，社会保险的缴费基数通常是根据职工上一年度月平均工资来确定的。然而，在实际操作中，缴费基数还会受到当地最低缴费基数和最高缴费基数的限制。具体来说：

1. 最低缴费基数：各地会根据经济发展水平、职工平均工资等因素设定社会保险的最低缴费基数。用人单位为职工缴纳社会保险时，缴费基数不得低于这个最低标准。

2. 最高缴费基数：同样，各地也会设定社会保险的最高缴费基数，以防止用人单位通过过高设定缴费基数来规避社会保险费用。

二、工资与缴费基数的关系

1. 工资低于最低缴费基数：如果职工的月工资低于当地规定的最低缴费基数，那么用人单位在缴纳社会保险时，应按照最低缴费基数来计算和缴纳。

2. 工资高于最低缴费基数但低于平均工资：在这种情况下，用人单位可以按照职工的实际工资作为缴费基数，也可以根据行业惯例或双方协商，在合理范围内设定一个略高于实际工资的缴费基数（但不得超过最高缴费基数）。

3. 工资高于最高缴费基数：如果职工的月工资高于当地规定的最高缴费基数，那么用人单位在缴纳社会保险时，应按照最高缴费基数来计算和缴纳。

三、针对本题的具体分析

1. 若4000元不低于当地最低缴费基数：

   • 如果当地规定的最低缴费基数低于4000元，且用人单位与劳动者协商一致或按照行业惯例等，将缴费基数设定为4000元，那么这一做法是合法的。

2. 若4000元低于当地最低缴费基数：

   • 如果当地规定的最低缴费基数高于4000元，那么用人单位将缴费基数设定为4000元就是违法的，因为这违反了社会保险缴费基数的最低限制。

3. 未经合法程序确定缴费基数：

   • 即使4000元不低于当地最低缴费基数，但如果用人单位未经与劳动者协商一致或未按照相关法律法规和政策规定来确定缴费基数，而是单方面设定了一个较高的缴费基数，这也可能引发劳动纠纷，因为这种做法可能损害了劳动者的合法权益。

四、建议

1. 查询当地政策：首先，建议查询当地的社会保险政策，了解最低缴费基数和最高缴费基数的具体规定。

2. 与用人单位沟通：如果发现自己的缴费基数与工资不符，且怀疑可能存在问题，建议与用人单位进行沟通，了解缴费基数的确定依据和过程。

3. 寻求法律帮助：如果与用人单位沟通无果，或者认为自己的合法权益受到了侵害，可以寻求法律帮助，比如向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律意见和帮助。

总之，工资与缴费基数之间的关系需要遵循相关法律法规和政策规定。如果发现自己的缴费基数存在问题，建议及时采取措施维护自己的合法权益。