企业年休假未休完的情况下，企业既可以选择安排补休，也可以选择支付加班费，但具体处理方式需依据实际情况和相关法律法规来确定。以下是对这一问题的详细分析：
补休的情况：
- 法律依据：根据《职工带薪年休假条例》第五条，单位根据生产、工作的具体情况，并考虑职工本人意愿，统筹安排职工年休假。年休假在1个年度内可以集中安排，也可以分段安排，一般不跨年度安排。单位因生产、工作特点确有必要跨年度安排职工年休假的，可以跨1个年度安排。这意味着，如果企业因工作原因未能安排职工在当年休完年休假，可以在征得职工同意的情况下，安排职工在下一年度补休。
- 实际操作：企业应与职工进行充分沟通，就补休的时间、方式等达成一致意见，并确保补休安排符合法律法规的规定。
支付加班费的情况：
- 法律依据：同样根据《职工带薪年休假条例》第五条，单位确因工作需要不能安排职工休年休假的，经职工本人同意，可以不安排职工休年休假。对职工应休未休的年休假天数，单位应当按照该职工日工资收入的300%支付年休假工资报酬，其中包含用人单位支付职工正常工作期间的工资收入。这意味着，如果企业因工作原因无法安排职工补休年休假，且职工同意不补休的，企业应按照法律规定支付加班费。
- 计算公式：年休假工资报酬的计算公式为：年休假工资报酬=职工日工资收入×应休未休年休假天数×300%（其中，职工日工资收入按照职工本人的月工资除以月计薪天数（21.75天）进行折算）。例如，某职工月工资为5000元，应休未休年休假天数为5天，则其应获得的年休假工资报酬为：5000元÷21.75天×5天×300%=3448.28元（结果四舍五入到小数点后两位）。
- 实际操作：企业在支付加班费时，应确保计算准确、支付及时，并保留好相关凭证以备查验。
特殊情况的处理：
- 如果企业与职工就年休假安排或加班费支付等问题发生争议，双方应首先通过协商解决。协商不成的，可以依法向劳动争议调解仲裁机构申请调解或仲裁，也可以直接向人民法院提起诉讼。
建议：
- 企业应建立健全年休假管理制度，明确年休假的安排、补休、加班费支付等流程和标准，确保符合法律法规的规定。
- 职工在享受年休假权益时，也应了解自己的权利和义务，积极与企业沟通协商，共同维护双方的合法权益。
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