综合计算工时制下，员工在法定节假日工作确实存在三倍工资的规定。以下是对这一问题的详细解析：
一、综合工时制的基本概念
综合计算工时工作制是一种特殊的工时制度，它适用于因工作性质特殊或受自然条件限制而需连续作业的行业。这种制度以周、月、季、年为周期综合计算工作时间，允许某一具体日（或周）的实际工作时间超过标准工作时间，但周期内总工作时间不得超过法定标准。
二、三倍工资的法律依据
根据《中华人民共和国劳动法》第四十四条的规定，法定休假日安排劳动者工作的，用人单位应支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。这是计算三倍工资的法律基础，同样适用于综合计算工时制下的员工。
三、三倍工资的具体计算方法
确定日工资标准：
- 日工资的计算公式为：日工资 = 月工资收入 ÷ 月计薪天数。
- 月计薪天数通常为21.75天，这是依据原劳动和社会保障部《关于职工全年月平均工作时间和工资折算问题的通知》确定的。
计算法定节假日加班工资：
- 法定节假日加班工资的计算公式为：法定节假日加班工资 = 日工资 × 300% × 法定节假日加班天数。
举例说明：
假设员工小张的月工资为6000元，在法定节假日加班1天，则其加班工资计算如下：
- 日工资 = 6000 ÷ 21.75 ≈ 275.86元（为便于计算，此处保留两位小数，实际计算中可根据需要保留更多位数）
- 法定节假日加班工资 = 275.86 × 300% × 1 = 827.58元
四、特殊情况与处理
综合计算周期内工时未超标准：
- 即使综合计算周期内总工时未超标，法定节假日加班仍需按300%支付加班工资。这是因为法定节假日是法定的休息日，员工在此期间工作应获得更高的报酬。
综合计算周期内工时超过标准：
- 对于超过法定标准工作时间的部分，应按不低于小时工资的150%支付加班工资。这是针对综合计算周期内总工时超标的情况下的加班工资计算方式。
五、实际操作中的注意事项
地区与行业差异：
- 具体计算方式可能因地区、行业及企业规定而有所不同。因此，在实际操作中，建议参考当地劳动法规和企业规章制度，以确保加班工资的合法支付。
记录与证明：
- 用人单位应准确记录员工的加班时间，并提供相应的加班证明。这是确保加班工资准确计算与及时支付的重要前提。
员工权益保障：
- 员工应了解自己的用工性质和用人单位的薪酬政策，以确保在法定节假日工作时的合法权益得到保障。如果用人单位未按规定支付加班工资，员工有权向劳动监察部门投诉或寻求法律援助。
综上所述，综合计算工时制下员工在法定节假日工作确实存在三倍工资的规定。用人单位应严格遵守相关法律法规，确保加班工资的准确计算与及时支付。如果您有任何关于劳动工伤（工资福利）方面的法律问题，可以直接向我咨询。