结论：公司请假超过3天多扣百分之十的工资是否违法，需根据具体情况判断，若该规定违反法律法规或劳动合同、集体合同的约定，则是违法的。以下从不同角度进行分析：

一、法律法规层面

1. 《中华人民共和国劳动法》相关规定：

   • 根据《劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。
   • 若公司因员工请假超过3天而多扣百分之十的工资，且该扣除没有法律依据或劳动合同、集体合同的约定，则构成克扣工资，是违法的。

2. 《中华人民共和国劳动合同法》相关规定：

   • 根据《劳动合同法》第三十条，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。
   • 若劳动合同或集体合同中未约定请假超过3天需多扣百分之十工资，公司擅自实施该规定，则违反了劳动合同的约定，也是违法的。

二、公司规章制度层面

1. 公司规章制度的合法性：

   • 公司规章制度应当符合法律法规的规定，且不得与劳动合同、集体合同的约定相冲突。
   • 若公司规章制度中规定了请假超过3天需多扣百分之十工资，但该规定违反了法律法规或劳动合同、集体合同的约定，则该规定无效，公司不能据此扣除员工工资。

2. 公司规章制度的制定程序：

   • 根据《劳动合同法》第四条，用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利、职工培训、劳动纪律以及劳动定额管理等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。
   • 若公司规章制度中关于请假扣除工资的规定未经上述程序制定，则可能因程序违法而无效。

三、实际操作建议

1. 核对劳动合同和集体合同：

   • 员工应首先核对自己的劳动合同和集体合同，看其中是否有关于请假扣除工资的约定。
   • 若合同中有约定，且该约定不违反法律法规，则公司可以按照约定扣除工资；若合同中无约定或约定违法，则公司不能扣除工资。

2. 与公司沟通协商：

   • 若员工认为公司扣除工资的规定违法或不合理，可以与公司进行沟通协商，要求公司改正。
   • 在沟通协商过程中，员工可以引用上述法律法规和合同约定作为依据。

3. 寻求法律援助：

   • 若沟通协商无果，员工可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
   • 在投诉或申请劳动仲裁时，员工需要提供相关证据证明公司扣除工资的规定违法或不合理。

总结：公司请假超过3天多扣百分之十的工资是否违法，需根据具体情况判断。若该规定违反法律法规或劳动合同、集体合同的约定，则是违法的。员工在遇到此类情况时，应首先核对合同约定，与公司沟通协商，并在必要时寻求法律援助。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。