两人签订的不动产权协议，在符合法定条件的情况下是生效的。不过，不动产权协议的生效并非仅由双方签字这一单一因素决定，还需要考虑多个方面，以下为你详细分析：

一、协议生效的基本条件

1. 主体适格：签订协议的双方必须具备相应的民事行为能力。例如，未成年人或精神病人等无民事行为能力人或限制民事行为能力人签订的协议，可能因主体不适格而无效或效力待定。
2. 意思表示真实：双方签订协议时，必须基于真实的意思表示，不存在欺诈、胁迫、乘人之危等情形。如果一方在签订协议时受到欺诈或胁迫，该协议可能因意思表示不真实而被撤销。
3. 内容合法：协议的内容必须符合法律法规的规定，不得违反公序良俗或损害国家、集体、第三人的利益。例如，协议中约定的不动产转让价格明显低于市场价，且无正当理由的，可能因损害国家税收利益而被认定为无效。
4. 形式合法：根据《民法典》的相关规定，不动产物权的设立、变更、转让和消灭，应当依照法律规定登记。因此，不动产权协议虽然自成立时生效，但不动产物权的变动需以登记为生效要件。如果双方仅签订了协议而未办理不动产登记手续，则不动产物权并未发生变动。

二、特殊情况下的协议效力

1. 未办理不动产登记手续：如前所述，不动产物权的变动需以登记为生效要件。如果双方签订了不动产权协议但未办理登记手续，虽然协议本身可能生效，但不动产物权并未发生变动。此时，如果一方反悔或拒绝履行协议，另一方可能无法直接依据协议要求对方办理不动产登记手续或承担违约责任（除非协议中有特别约定）。不过，未办理登记手续并不影响协议的效力，如果一方因违约给另一方造成损失的，仍应承担赔偿责任。
2. 协议存在瑕疵：如果协议存在瑕疵（如条款不明确、存在歧义等），可能影响协议的履行和效力。在这种情况下，双方可以协商补充协议或对原协议进行修正。如果协商不成，可能需要通过诉讼或仲裁等方式解决争议。

三、法律建议

1. 签订协议前谨慎审查：在签订不动产权协议前，双方应仔细审查协议内容，确保协议条款明确、无歧义，并符合法律法规的规定。
2. 及时办理不动产登记手续：为了确保不动产物权的变动生效，双方应在签订协议后及时办理不动产登记手续。
3. 保留相关证据：在签订和履行协议过程中，双方应保留好相关证据（如协议文本、付款凭证、沟通记录等），以便在发生争议时维护自己的合法权益。

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