年终奖发放差异是否合法及应对措施需分情况讨论，具体如下：

1. 若年终奖发放标准明确且合法，差异可能合理
   若公司通过合法程序（如民主协商、公示等）制定了明确的年终奖发放规则（如与绩效、考勤、岗位价值等挂钩），且规则本身不违反《劳动法》《劳动合同法》中关于同工同酬、禁止歧视等强制性规定，则年终奖差异可能被认定为合理。
   建议：员工可要求公司出具书面发放规则，核对自身是否符合规则条件；若认为规则不公，可通过工会或职工代表大会提出异议，但需注意规则已生效时，直接主张差异违法的难度较大。

2. 若年终奖发放无明确规则或规则违法，差异可能不合法
   若公司未制定书面规则，或规则存在以下情形：

   • 歧视性条款（如仅针对特定性别、年龄、地域员工降低奖金）；
     
   • 违反同工同酬原则（如相同岗位、相同绩效但奖金差异显著）；
     
   • 未通过民主程序制定（如单方面决定扣减奖金）。
     则年终奖差异可能被认定为违法，员工有权要求公司补足差额。
     建议：收集证据（如劳动合同、往年奖金发放记录、同事证言等），向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，主张公司支付差额及可能的赔偿金。

3. 若年终奖属于“口头承诺”或“惯例”，需结合证据判断
   若公司虽未书面约定年终奖，但长期按惯例发放，或老板曾口头承诺奖金数额，员工可能基于“信赖利益”主张权利。但此类案件中，证据的充分性至关重要（如录音、聊天记录、邮件等）。
   建议：尽快固定证据（如补签书面协议、要求公司出具奖金说明），避免因证据不足导致维权失败。

总结：年终奖差异是否合法需结合发放规则、程序及证据综合判断。若认为自身权益受损，建议先与公司协商，协商不成时及时通过法律途径维权。如有具体案例或证据，可进一步向我咨询，我将结合细节提供针对性分析。