在综合计算工时工作制下，工资的计算是一个相对复杂但又有明确规则的过程。以下是对这一问题的详细解答：
一、综合计算工时工作制概述
综合计算工时工作制是一种针对工作性质特殊或受自然条件限制的行业而设定的工时制度。它允许以周、月、季、年等为周期，综合计算工作时间，但要求平均工作时间和平均周工作时间与法定标准基本相同，即平均每日工作不超过8小时，平均每周工作不超过40小时。这种制度主要适用于交通、铁路、邮电、水运、航空、渔业、建筑、旅游等行业和岗位。
二、工资计算的核心要点
正常工作时间工资：
- 在综合计算周期内，如果职工的实际工作时间未超过法定标准工作时间，那么工资将按照劳动合同约定的正常工作时间工资标准支付。
延长工作时间工资：
- 如果实际工作时间超过了标准工作时间，但并非在休息日或法定节假日工作，通常按正常工作时间支付工资。不过，部分地方可能有特别规定，要求支付加班费或安排补休，这时需遵循当地法规。
- 若超时工作在休息日进行，则需支付不低于本人小时工资标准的150%作为加班工资。
法定节假日工作工资：
- 在法定节假日安排工作的，用人单位需支付不低于劳动者本人小时工资标准的300%作为加班工资，且这部分工资不计入综合计算周期内的工作时间。
三、具体计算方法
确定标准工作时间与实际工作时间：
- 标准工作时间通常按每日8小时、每周40小时或根据当地法律法规规定的月度、季度、年度标准工作时间来计算。
- 实际工作时间是职工在综合计算周期内实际投入的工作时间，需要严格统计。
计算正常工作时间工资：
- 根据劳动合同约定的正常工作时间工资标准和实际工作时间（未超过标准工作时间部分）来计算。
计算延长工作时间和法定节假日工作工资：
- 延长工作时间（非休息日或法定节假日）的工资计算，需根据当地法规来确定是否支付加班费。
- 休息日工作的，按不低于本人小时工资标准的150%支付加班工资。
- 法定节假日工作的，按不低于本人小时工资标准的300%支付加班工资。
四、实例说明
假设某职工所在企业实行季度综合计算工时工作制，法定标准工作时间为每季度500小时，小时工资为20元。
- 若该职工季度内实际工作480小时，则正常工资为480小时 × 20元/小时 = 9600元。
- 若该职工季度内实际工作520小时，其中20小时为延长工作时间（非休息日或节假日），且当地法规未要求支付这20小时的加班费，则总工资为500小时 × 20元/小时 + 20小时 × 20元/小时（这里虽按正常算，但实际可能需根据地方规定调整） = 10400元；若地方有特别规定要求支付加班费，则需按规定执行。
- 若该职工在国庆节加班一天（8小时），则国庆节加班工资为8小时 × 20元/小时 × 300% = 480元，需单独计算并加入总工资中。
五、注意事项
- 各地可能会根据实际情况制定相关实施细则和补充规定，因此在具体计算工资时，务必结合当地的法律法规和政策要求。
- 用人单位应确保工资计算方式的透明性和合法性，避免侵犯职工的合法权益。同时，要合理安排职工的工作时间，确保不超过法定标准，并按照规定支付加班费。
综上所述，综合计算工时工作制下的工资计算方式需综合考虑多种因素，包括实际工作时间、标准工作时间以及是否涉及休息日或法定节假日等。用人单位应严格按照法律法规和政策要求执行，确保职工的合法权益得到充分保障。