结论：对于拥有20年工龄但在新单位仅入职3年的员工，单位只给5天年假是不合法的。根据《职工带薪年休假条例》的相关规定，该员工应享受15天的年休假。

详细分析：

1. 法律依据：

   • 根据《职工带薪年休假条例》第三条，职工累计工作年限是决定年休假天数的关键因素。具体规定为：已满10年不满20年的，年休假为10天；已满20年的，年休假为15天。这一规定明确了工龄与年假天数的直接关系，不受员工在新单位工作年限的影响。

2. 员工权益：

   • 在您的情况下，由于您已有20年的工龄，因此依法应享受15天的年休假。单位只给5天年假，显然违反了上述法律规定，侵害了您依法享有的带薪年休假权益。

3. 维权途径：

   • 协商：首先，您可以尝试与单位进行协商，明确表达您的权益和诉求，要求单位按照法律规定给予应有的年假天数。
   • 投诉或仲裁：若协商不成，您有权向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。在投诉或申请仲裁前，建议您搜集好相关证据，如劳动合同、工资单、社保缴纳记录等，以证明您的工龄和应享有的年假天数。

4. 特殊情况说明：

   • 需要注意的是，国家法定休假日和休息日并不计入年休假的假期。此外，虽然存在一些特殊情况可能影响员工的年休假权益，如员工依法享受寒暑假且休假天数多于年休假天数，或者员工请事假、病假累计达到一定天数等，但这些情况并不适用于您当前的情况，因为您是基于20年的工龄来主张应享有的15天年休假。

建议：

• 在与单位协商或投诉、仲裁过程中，保持冷静和理性，依法维护自己的权益。
• 准备好相关证据，确保自己的主张有充分的法律依据支持。
• 如有需要，可以寻求专业律师的帮助，以更好地维护自己的合法权益。

如果您在维权过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我将竭诚为您提供专业的法律服务。