针对您提出的“三人合伙开店现在有一人退出怎么结算”的问题，这是一个涉及合伙清算的复杂但关键的过程。以下是我为您详细梳理的清算步骤和建议：

一、查阅合伙协议

首先，您需要详细查阅合伙协议中关于退伙、清算及财产分配的条款。这些条款是合伙人之间关于合伙事项的重要约定，通常会明确规定退伙的条件、程序、清算方式、财产分配比例以及债务承担方式等。如果合伙协议中有明确规定，那么您应严格按照协议的约定来执行清算。

二、评估店铺资产与负债

若合伙协议无明确规定或规定不明，接下来您需要对合伙店铺的所有财产进行全面的清查和评估。这包括：

1. 固定资产：如房屋、设备、家具等，需要盘点并评估其当前价值，考虑折旧因素。
2. 流动资产：包括库存商品、现金、银行存款、应收账款等，进行盘点和核对，确定其实际价值。
3. 无形资产：如商标、商号、专利技术等，虽然难以直接量化，但也需要进行合理评估。

同时，您还需要列出店铺的所有负债，包括外部债务（如货款、借款、水电费等）和内部债务（合伙人之间的借款等），确保债务清晰明了。

三、计算净资产与确定退伙人权益

在评估完资产和负债后，您需要从总资产中扣除总负债，得出店铺的净资产值。然后，根据合伙协议中的约定（如有）或相关法律法规，计算出退伙人在店铺中的权益份额。这通常基于其出资比例、贡献度或其他约定的标准。如果协议无明确约定，则需要通过协商来确定。

四、协商并执行分配方案

接下来，您需要与退伙人协商并达成一致意见，确定具体的分配方案。这可能包括一次性支付、分期支付或以其他形式（如转让部分资产）进行支付。在协商过程中，应充分考虑合伙人的出资情况、贡献大小以及店铺的实际经营状况等因素，确保分配方案公平合理。

五、处理相关手续与文件

完成清算工作后，您还需要办理一些相关的手续，以确保退伙事项的合法性和完整性。这包括：

1. 签订退伙协议：退伙人和其他合伙人应当签订书面的退伙协议，明确退伙的时间、财产分配情况、债务承担方式等重要事项。
2. 变更登记或注销登记：如果合伙店铺进行了工商登记，您需要到工商行政管理部门办理合伙人变更登记手续，将退伙人的信息从登记文件中移除。
3. 保留相关记录和文件：在整个清算过程中，务必保留所有相关的记录和文件，以备未来可能出现的争议或法律诉讼之需。

六、寻求专业帮助（如需）

如果合伙协议中没有明确规定清算的具体方式，或者双方对清算结果有异议，我建议您寻求专业律师的帮助来协助处理清算事宜。专业律师能够提供准确的法律咨询和有效的解决方案，确保双方的权益得到妥善保护。

举例说明

假设您和另外两位合伙人A、B共同出资开了一家餐厅，您出资30%，A出资40%，B出资30%。经营一段时间后，B决定退出合伙。经过清算，餐厅的净资产为100万元。按照出资比例，您应分得30万元，A应分得40万元，B应分得30万元。双方签订退伙协议后，您和A按照协议支付B30万元，并到工商行政管理部门办理了合伙人变更登记手续。整个清算过程顺利完成，双方权益得到妥善保护。

希望以上解答能够对您有所帮助。如果您在清算过程中遇到任何问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。