结论：公司开除拒绝操作机床的员工是否违法，不能一概而论，需根据具体情况判断。以下从不同角度进行分析：
员工拒绝操作机床的合法性
- 若员工有合理理由：例如，员工持有有效的医疗证明，表明操作机床可能对其健康造成严重危害；或者员工发现机床存在安全隐患，且公司未采取必要措施消除隐患。在这些情况下，员工有权拒绝操作机床，且公司不得因此开除员工。若公司开除，则可能构成违法解除劳动合同，需承担相应的法律责任。
- 若员工无合理理由：如果员工没有合理的理由拒绝操作机床，且该操作属于其劳动合同中约定的工作内容，那么员工的行为可能构成违反公司规章制度或劳动合同约定。在此情况下，公司有权依据相关规章制度或劳动合同对员工进行处理，包括开除。但公司需确保处理程序合法合规，如提前通知员工、听取员工申辩等。
公司开除员工的合法性
- 合法解除劳动合同的情形：根据《劳动合同法》的相关规定，公司可以在员工严重违反公司规章制度、严重失职或营私舞弊给公司造成重大损害等情形下解除劳动合同。若员工拒绝操作机床的行为符合这些情形，且公司能够提供充分证据证明，则公司开除员工可能是合法的。
- 违法解除劳动合同的情形：如果公司无法证明员工拒绝操作机床的行为构成严重违反公司规章制度或劳动合同约定，或者公司未按照法定程序进行解除，那么公司开除员工可能构成违法解除劳动合同。在此情况下，员工有权要求公司继续履行劳动合同或支付赔偿金。
建议与注意事项
- 对于员工：如果因合理理由拒绝操作机床而被公司开除，建议收集相关证据（如医疗证明、安全隐患报告等）以证明自己的合理性，并考虑通过法律途径维护自己的权益。
- 对于公司：在开除员工前，应确保员工的行为确实构成违反公司规章制度或劳动合同约定，并按照法定程序进行解除。同时，公司应建立健全的规章制度和劳动合同管理机制，以减少类似纠纷的发生。
可能涉及的法律后果：
- 若公司违法解除劳动合同，员工有权要求公司继续履行劳动合同或支付赔偿金。赔偿金的计算通常依据员工在公司的工作年限和工资水平来确定。
- 若员工因拒绝操作机床而给公司造成损失，公司有权要求员工承担赔偿责任，但需证明损失与员工行为之间的因果关系。
进一步行动建议：
- 如果您或您的公司面临类似情况，建议直接向我咨询，以便根据具体情况提供更详细的法律建议和解决方案。