结论前置：职业禁忌症员工在辞职时是否有赔偿，需根据具体情况分析。若员工主动离职且用人单位无违法行为，通常无赔偿；若用人单位存在违法行为或解除劳动合同的情形符合法律规定，则员工可能有权获得经济补偿或赔偿。

一、员工主动离职的情况

1. 一般情况：

   • 若员工因自身职业禁忌症主动提出解除劳动合同，且用人单位不存在违法违规行为（如未提供劳动保护、未及时支付工资等），则用人单位无需支付经济赔偿。这是因为员工的离职是自主决定，用人单位并未违反相关法律法规。

2. 存在法定情形：

   • 若用人单位存在违法违规行为，即使员工因职业禁忌症主动离职，也有权要求经济补偿。经济补偿的标准按工作年限计算，每满一年支付一个月工资。例如，若员工在用人单位工作了三年，则有权要求用人单位支付三个月工资作为经济补偿。

二、用人单位解除劳动合同的情况

1. 禁止解除的情形：

   • 用人单位不得因劳动者有职业禁忌症而解除劳动合同，特别是在诊断或医学观察期间，或因工负伤丧失劳动能力的情况下。若用人单位违反此规定解除劳动合同，员工有权要求支付赔偿金，标准为经济补偿的二倍。

2. 可以解除的特殊情况：

   • 若员工因职业禁忌症不能从事原工作或另行安排的工作，用人单位在提前三十日以书面形式通知或额外支付一个月工资后，可以解除劳动合同。但此时，用人单位需支付经济补偿，补偿标准同样按工作年限计算。

三、经济补偿与赔偿的具体标准

1. 经济补偿标准：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十七条，经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。劳动者月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍的，向其支付经济补偿的标准按职工月平均工资三倍的数额支付，向其支付经济补偿的年限最高不超过十二年。月工资是指劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。

2. 赔偿标准：

   • 若用人单位违法解除劳动合同，员工有权要求支付赔偿金，赔偿金为经济补偿的二倍。例如，若员工应得的经济补偿为三个月工资，则赔偿金为六个月工资。

四、建议与注意事项

1. 及时报告与申请：

   • 劳动者在被诊断出职业禁忌症后，应及时向用人单位报告，并申请工伤认定（若符合工伤认定条件）。这有助于确保劳动者的权益得到及时保障。

2. 保留证据：

   • 劳动者应保留好相关证据，如医疗证明、劳动合同、工资单等。这些证据在后续维权过程中将起到关键作用。

3. 了解自身权益：

   • 劳动者应充分了解自己的权益和申请赔偿的具体流程。在必要时，可以直接向我咨询，以获取更具体的法律建议和帮助。

综上所述，职业禁忌症员工在辞职时是否有赔偿，需根据具体情况分析。在实际操作中，应遵循相关法律法规，确保合法权益得到保障。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。