结论：员工因病假2个月不到一年，公司扣年终奖的行为是否合法，需根据具体情况判断，包括公司规章制度、劳动合同约定以及相关法律法规的规定。
分析角度一：公司规章制度与劳动合同
公司规章制度：
- 首先，需要查看公司的规章制度中是否有关于病假期间年终奖发放的具体规定。如果公司规章制度明确规定，病假期间不享受年终奖或按一定比例扣减，且该规章制度已经过民主程序制定并公示，或者已经告知员工，那么公司扣年终奖的行为可能是合法的。
- 反之，如果公司规章制度中没有相关规定，或者规定不明确，那么公司扣年终奖的行为可能缺乏依据。
劳动合同约定：
- 劳动合同是员工与公司之间约定权利义务的重要文件。如果劳动合同中明确约定了年终奖的发放条件、方式以及病假期间的处理方式，那么公司应按照劳动合同的约定执行。
- 如果劳动合同中没有相关约定，或者约定不明确，那么公司扣年终奖的行为可能构成违约。
分析角度二：相关法律法规
《劳动法》与《劳动合同法》：
- 根据《劳动法》和《劳动合同法》的相关规定，员工享有获得劳动报酬的权利，包括基本工资和奖金等。年终奖作为奖金的一种形式，通常也被视为劳动报酬的一部分。
- 如果公司扣年终奖的行为违反了法律法规的强制性规定，如未按照劳动合同约定支付劳动报酬等，那么员工有权要求公司支付被扣的年终奖，并可能获得相应的经济补偿。
地方性法规与政策：
- 除了国家层面的法律法规外，不同地区可能还有地方性法规或政策对年终奖的发放进行具体规定。因此，在判断公司扣年终奖的行为是否合法时，还需要考虑当地的地方性法规和政策。
建议与行动：
与公司协商：
- 如果员工认为公司扣年终奖的行为不合法或不合理，可以首先尝试与公司进行协商，了解公司扣年终奖的具体原因和依据，并尝试达成和解。
申请劳动仲裁：
- 如果协商无果，员工可以向当地劳动仲裁机构申请劳动仲裁，要求公司支付被扣的年终奖，并可能获得相应的经济补偿。在申请劳动仲裁时，员工需要提供相关证据证明公司扣年终奖的行为不合法或不合理。
寻求法律援助：
- 如果员工在劳动仲裁过程中遇到困难或需要法律帮助，可以寻求专业律师的法律援助。律师可以根据具体情况为员工提供法律咨询、代理诉讼等服务。
可能后果：
- 如果公司扣年终奖的行为被认定为违法或不合理，公司可能需要支付被扣的年终奖给员工，并可能面临劳动仲裁机构的处罚或诉讼风险。
- 如果员工未能提供充分证据证明公司扣年终奖的行为不合法或不合理，或者公司规章制度、劳动合同中有明确规定且符合法律法规要求，那么员工可能无法获得被扣的年终奖。
总之，员工因病假2个月不到一年，公司扣年终奖的行为是否合法需根据具体情况判断。如有疑问或需要进一步帮助，请直接向我咨询。