结论前置：员工不按规定的时间来上班，用人单位不一定可以直接扣钱，这需要根据具体情况和相关法律法规来判断。

详细分析：

1. 规章制度与劳动合同的约定：

   • 首先，用人单位应查看其规章制度以及与员工签订的劳动合同中是否有关于迟到、旷工等行为的处罚规定。如果规章制度或劳动合同中明确规定了对于不按规定时间上班的处罚措施，包括扣钱等，且这些规定不违反法律法规的强制性规定，那么用人单位可以依据这些规定对员工进行相应的处罚。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》第四条，用人单位应当依法建立和完善劳动规章制度，保障劳动者享有劳动权利、履行劳动义务。同时，该法第三十九条也规定了劳动者严重违反用人单位的规章制度的，用人单位可以解除劳动合同。虽然这里并未直接提及扣钱，但规章制度中可以合理设定罚款等处罚措施，前提是不违反法律法规。

2. 罚款的合法性与合理性：

   • 即使规章制度或劳动合同中有关于罚款的规定，用人单位也需要确保这些规定是合法且合理的。罚款的数额应当与员工的违规行为相匹配，不能过高或过低，且不能违反法律法规中关于工资支付、最低工资标准等规定。
   • 实践建议：在实际操作中，用人单位应谨慎使用罚款措施，避免因为罚款过高或不合理而引发劳动争议。如果可能的话，可以考虑采用其他更温和的处罚方式，如警告、记过等。

3. 地方性法规与政策：

   • 此外，用人单位还需要关注所在地区的地方性法规和政策。不同地区可能对于罚款等处罚措施有不同的规定和限制，用人单位需要确保自己的行为符合当地法律法规的要求。
   • 举例说明：例如，某些地区可能规定用人单位不得对员工进行罚款，或者对罚款的数额有明确的上限。在这种情况下，用人单位就不能随意对员工进行罚款。

4. 劳动争议的处理：

   • 如果员工对用人单位的罚款决定不服，可以通过劳动争议调解、仲裁或诉讼等途径来维护自己的合法权益。在这种情况下，用人单位需要提供充分的证据来证明自己的罚款决定是合法且合理的。
   • 风险提示：用人单位在处理劳动争议时，应积极配合调解、仲裁或诉讼程序，避免因为处理不当而引发更大的法律风险。

总结与建议：

• 对于员工不按规定时间上班的情况，用人单位应首先查看其规章制度和劳动合同中的相关规定。
• 如果规章制度或劳动合同中有关于罚款的规定，用人单位需要确保这些规定是合法且合理的，并符合当地法律法规的要求。
• 在实际操作中，用人单位应谨慎使用罚款措施，避免引发劳动争议。
• 如果员工对罚款决定不服，用人单位应积极配合处理劳动争议，并提供充分的证据来证明自己的决定是合法且合理的。

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