认定企业不定时工作制违法，主要可以从以下几个方面进行考量：
未依法履行审批程序：
- 根据相关法律法规，企业实行不定时工作制需要经过劳动行政部门的审批。如果企业未按照法定程序进行审批，或者审批未通过而擅自实行不定时工作制，那么这种行为就是违法的。
- 法律依据：虽然具体审批程序可能因地区而异，但通常都要求企业向当地劳动行政部门提交申请，并提供相关材料证明实行不定时工作制的必要性和合理性。
未与劳动者协商一致：
- 实行不定时工作制需要得到劳动者的同意。如果企业未与劳动者进行充分协商，或者劳动者明确表示不同意实行不定时工作制，而企业仍然强行实施，那么这种行为也是违法的。
- 实践建议：企业在实行不定时工作制前，应当与劳动者进行充分沟通，解释实行不定时工作制的原因、目的和具体安排，并征得劳动者的同意。
违反工作时间和休息休假规定：
- 即使企业实行了不定时工作制，也必须遵守国家关于工作时间和休息休假的规定。例如，劳动者每日工作时间不得超过8小时，平均每周工作时间不得超过44小时；劳动者有权享受法定节假日、年休假等休息休假权利。
- 违法情形：如果企业实行不定时工作制后，导致劳动者工作时间过长、休息休假权利受到侵害，那么这种行为就是违法的。
未支付加班费或未按规定支付加班费：
- 在不定时工作制下，劳动者的工作时间可能不固定，但并不意味着企业可以随意安排劳动者加班而不支付加班费。如果劳动者在法定节假日、休息日等特定时间工作，企业应当按照国家规定支付加班费。
- 计算公式（以法定节假日加班为例）：加班费 = 月工资基数 ÷ 21.75天 × 300% × 加班天数。其中，月工资基数是指劳动者在劳动合同中约定的工资，或者企业实际支付的工资（不包括加班费、奖金等）。21.75天是月平均计薪天数。
未保障劳动者其他合法权益：
- 实行不定时工作制不得影响劳动者的其他合法权益，如社会保险缴纳、劳动保护等。如果企业因实行不定时工作制而损害了劳动者的这些权益，那么这种行为也是违法的。
针对企业不定时工作制违法的处理建议：
- 如果劳动者发现企业实行的不定时工作制存在上述违法情形，可以向当地劳动行政部门投诉或举报，要求劳动行政部门进行调查处理。
- 劳动者也可以与企业进行协商，要求企业纠正违法行为，并赔偿因此给劳动者造成的损失。
- 如果协商无果，劳动者可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，或者向人民法院提起诉讼，通过法律途径维护自己的合法权益。
总结：认定企业不定时工作制违法需要综合考虑多个方面，包括审批程序、与劳动者的协商、工作时间和休息休假规定、加班费支付以及劳动者其他合法权益的保障等。如果企业存在上述违法情形，劳动者有权向相关部门投诉或举报，并通过法律途径维护自己的权益。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。