对于未经批准实施不定时工作制的情况，主要会面临劳动行政部门的责令改正及可能的罚款处罚，同时，若因此引发劳动争议，用人单位还可能需承担不利法律后果。以下是对此问题的详细分析：
一、劳动行政部门的处罚
责令改正：
- 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，用人单位实行不定时工作制或综合计算工时工作制，需经劳动行政部门批准。若未经批准擅自实行，劳动行政部门有权责令用人单位限期改正。
罚款处罚：
- 若用人单位在劳动行政部门责令改正后，仍未改正的，劳动行政部门可以依据相关规定对用人单位进行罚款。罚款的具体数额会根据违法情节的严重程度、用人单位的规模、违法行为的持续时间等因素综合确定。
二、劳动争议中的法律后果
加班费支付问题：
- 不定时工作制下，劳动者的工作时间不受固定工时限制，因此，在一般情况下，用人单位无需支付加班费。但是，若用人单位未经批准擅自实行不定时工作制，且劳动者能够证明存在加班事实的，用人单位仍需按照法律规定支付加班费。
劳动合同效力问题：
- 若用人单位与劳动者在劳动合同中约定了不定时工作制，但未经劳动行政部门批准，该约定可能因违反法律强制性规定而被认定为无效。在此情况下，用人单位需按照标准工时制支付劳动者工资及加班费。
劳动者解除劳动合同及经济补偿：
- 若用人单位未经批准擅自实行不定时工作制，且该行为严重影响了劳动者的休息休假权益，劳动者有权依据《中华人民共和国劳动合同法》的规定解除劳动合同，并要求用人单位支付经济补偿。
三、实际操作建议
合规申请：
- 用人单位在实行不定时工作制前，应依法向劳动行政部门提出申请，并获得批准。这是避免法律风险的关键步骤。
完善劳动合同：
- 在劳动合同中明确约定工作制类型，并确保该约定符合法律规定。若实行不定时工作制，应明确告知劳动者并获得其同意。
关注劳动者权益：
- 即使实行不定时工作制，用人单位也应关注劳动者的休息休假权益，合理安排劳动者的工作和休息时间，避免过度加班和疲劳工作。
温馨提示：若您作为用人单位或劳动者，在遇到未经批准的不定时工作制相关问题时，建议直接向我咨询，以便根据具体情况提供更详细的法律建议和解决方案。