民事纠纷案件由行政庭审理是否合理，需根据具体案件性质和法院内部职能分工来判断，一般情况下不合理，但特定情形下可能合理。以下从不同角度进行分析：
一、一般情况下不合理
职能分工原则：
- 在法院内部，不同审判庭通常根据案件类型进行职能分工。民事纠纷案件一般由民事审判庭负责审理，而行政庭则主要负责审理行政诉讼案件，即公民、法人或其他组织认为行政机关的行政行为侵犯其合法权益而提起的诉讼。
- 民事审判庭和行政审判庭在审判人员、审判程序、审判重点等方面均存在差异。民事审判庭更侧重于审查民事法律关系的成立、变更和消灭，以及民事责任的承担等；而行政审判庭则更侧重于审查行政行为的合法性。
案件性质不符：
- 民事纠纷案件主要涉及平等主体之间的财产关系和人身关系，如合同纠纷、侵权纠纷等。这些案件的性质与行政诉讼案件存在本质区别，行政诉讼案件主要涉及行政机关与行政相对人之间的行政法律关系。
- 因此，将民事纠纷案件交由行政庭审理，可能不符合案件性质的要求，也不利于保障当事人的合法权益。
二、特定情形下可能合理
法院内部职能调整：
- 在某些特殊情况下，如法院内部职能调整、审判资源优化配置等，法院可能会将部分民事纠纷案件交由行政庭或其他审判庭审理。但这种情况通常较为罕见，且需要法院内部有明确的职能分工和审判程序规定。
案件涉及行政因素：
- 如果民事纠纷案件中涉及行政机关的行政行为，且该行政行为对民事法律关系的成立、变更或消灭产生重大影响，那么该案件可能具有一定的行政诉讼性质。在这种情况下，法院可能会根据案件的具体情况，决定由行政庭或民事审判庭审理。但这种情况下的审理仍然需要遵循民事诉讼或行政诉讼的相关程序规定。
三、法律建议
了解法院职能分工：
- 在涉及民事纠纷案件时，当事人应了解法院内部的职能分工情况，以便更好地选择适合自己的审判庭进行诉讼。
咨询专业律师：
- 如果当事人对法院的职能分工或案件的审理程序存在疑问，可以咨询专业律师以获取更准确的法律意见。作为专业律师，我可以根据案件的具体情况，为当事人提供针对性的法律建议和诉讼策略。
关注案件审理进展：
- 在案件审理过程中，当事人应密切关注案件的审理进展情况，及时与法院沟通并了解案件的最新动态。如果发现案件被错误地交由行政庭审理或其他不符合程序规定的情况，当事人可以及时向法院提出异议或申请复议。