民事纠纷案件通常不会在行政庭进行判决，因为行政庭主要负责审理与行政行为相关的案件，而民事纠纷一般由民事审判庭处理。不过，也存在一些特殊情况，下面我将从不同角度为你详细分析：

1. 一般原则：

   • 在大多数情况下，民事纠纷案件，如合同纠纷、侵权纠纷等，都是由法院的民事审判庭进行审理和判决的。行政庭则主要负责审理公民、法人或其他组织认为行政机关的行政行为侵犯其合法权益而提起的诉讼，即行政诉讼。

2. 特殊情况：

   • 行政附带民事诉讼：在某些特定情况下，如行政机关在行使职权过程中侵犯了公民、法人或其他组织的民事权益，且该民事权益的争议与行政行为的合法性紧密相关时，法院可能会在行政诉讼中一并审理民事争议，但这并不意味着民事纠纷完全由行政庭判决，而是行政庭在审理行政行为合法性的同时，对相关的民事争议进行一并处理。不过，这种情况下的民事争议处理仍然遵循民事法律的原则和规定。
   • 涉及行政协议的民事纠纷：如果民事纠纷涉及行政机关与公民、法人或其他组织之间签订的行政协议（如政府特许经营协议、土地房屋征收补偿协议等），且争议焦点在于行政协议的履行、解释或效力等问题，这类案件可能由行政庭审理。但即便如此，行政庭在审理时也会依据民事法律的相关规定来处理行政协议中的民事争议部分。

3. 法律后果与建议：

   • 法律后果：如果民事纠纷案件被错误地提交到了行政庭，且行政庭作出了判决，那么该判决可能因程序不当而被撤销或改判。因为行政庭和民事审判庭在审理案件时适用的法律、程序和原则都有所不同。
   • 建议：如果你发现自己涉及的民事纠纷案件被提交到了行政庭，或者对案件的审理庭室有疑问，你可以及时向法院提出异议，并要求将案件移送至民事审判庭进行审理。同时，你也可以咨询专业律师，了解案件的具体情况和可能的法律后果，以便更好地维护自己的合法权益。

总结来说，民事纠纷案件通常不会在行政庭进行判决，但在某些特殊情况下可能涉及行政庭的审理。如果你对案件的审理庭室有疑问或担忧，建议及时咨询专业律师以获取更具体的法律建议。如果你有任何法律问题，特别是刑事辩护、医疗纠纷、建设工程、行政纠纷领域的问题，都可以直接向我咨询。