在民事案件审理过程中，若发现案件实质属于行政案件，法院通常会裁定驳回起诉，并告知原告向有管辖权的行政审判庭或行政法院提起行政诉讼。具体分析如下：

1. 案件性质与管辖权
   民事案件与行政案件的核心区别在于争议性质：民事案件调整平等主体间的人身或财产关系，而行政案件解决行政机关与相对人间的行政法律关系。若审理中发现争议涉及行政机关的具体行政行为（如行政许可、处罚、强制等），且该行为是争议的核心标的，则案件性质应认定为行政案件。根据《行政诉讼法》及相关司法解释，行政案件由行政审判庭或专门行政法院管辖，民事审判庭无权继续审理。

2. 法院的处理程序

   • 裁定驳回起诉：法院会依据《民事诉讼法》第157条（或相关司法解释）裁定驳回原告的民事起诉，理由为“不属于民事诉讼受案范围”。
     
   • 释明与引导：法院需向原告释明案件性质，告知其应通过行政诉讼途径解决争议，并说明行政诉讼的起诉条件、管辖法院及程序要求。
     
   • 材料移送（如需）：若案件已进入实体审理阶段，法院可能将相关材料移送至有管辖权的行政审判庭或行政法院，但此步骤非强制，实践中多由原告自行重新起诉。

3. 原告的救济途径

   • 提起行政诉讼：原告需在法定期限内（通常为知道行政行为之日起6个月内）向有管辖权的法院提交行政起诉状，并附相关证据材料。
     
   • 注意起诉条件：行政诉讼需满足“有明确的被告、具体的诉讼请求和事实根据、属于法院受案范围”等条件，原告需确保起诉符合《行政诉讼法》第49条的规定。
     
   • 避免程序空转：若原告坚持按民事案件起诉，法院将不予受理或驳回起诉，可能导致诉讼周期延长，建议原告及时调整诉讼策略。

4. 特殊情形处理

   • 行政协议纠纷：若争议涉及行政机关与相对人签订的行政协议（如政府特许经营协议、土地房屋征收补偿协议等），根据《行政诉讼法》第12条第11项，此类纠纷属于行政诉讼受案范围，法院应按行政案件处理。
     
   • 民行交叉案件：若民事案件的审理需以行政行为的合法性审查为前提（如房屋所有权确认纠纷中涉及行政机关的登记行为），法院可能中止民事诉讼，待行政诉讼结果出具后再恢复审理，或直接裁定驳回起诉并引导原告先行解决行政争议。

总结：民事案件审理中发现属于行政案件的，法院会裁定驳回起诉并引导原告提起行政诉讼。原告需根据争议性质选择正确的诉讼途径，避免因程序错误导致权益受损。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体案件的处理方案。