若二审中发现案件实为行政案件，对一审民事判决的处理方式需分情况讨论，具体如下：
若一审法院无管辖权或案件性质认定错误，二审法院应裁定撤销原判，驳回起诉或移送有管辖权的行政审判庭
根据《行政诉讼法》及相关司法解释，若案件本质属于行政争议（如涉及行政机关具体行政行为的合法性审查），而一审法院误按民事案件受理，二审法院需审查程序合法性。若确认属于行政诉讼受案范围，应裁定撤销一审判决，并根据情况处理：
若案件同时涉及民事与行政法律关系交叉，二审法院可中止民事诉讼，引导当事人先行解决行政争议
若案件存在“民行交叉”情形（如行政许可行为导致民事权益受损），且行政争议的解决是民事案件审理的前提，二审法院可依据《最高人民法院关于适用〈行政诉讼法〉的解释》第137条，裁定中止民事诉讼，告知当事人通过行政复议或行政诉讼解决行政争议，待行政争议解决后恢复民事诉讼。
示例：房屋登记行为被撤销前，房屋买卖合同纠纷的民事判决可能因标的物权属不明而无法成立，此时需先通过行政诉讼确认登记行为效力。
若一审判决已部分履行或涉及公共利益，二审法院可酌情判决撤销、变更或维持部分内容
若一审判决已实际履行（如赔偿款已支付）或撤销判决可能损害公共利益（如涉及城市规划、环境保护等行政行为），二审法院可能根据《行政诉讼法》第77条（行政诉讼变更判决）或《民事诉讼法》第177条（二审对原判的处理），在纠正程序错误的同时，对实体内容作出调整。例如，若行政行为部分违法但撤销会导致更大损失，法院可能判决确认违法并责令行政机关采取补救措施，而非直接撤销一审民事判决。
总结建议：二审中发现案件性质错误时，法院会优先纠正程序问题，确保案件进入正确的诉讼轨道。若您遇到此类情况，需结合具体案情（如行政行为类型、民事争议焦点、一审判决履行情况等）进一步分析。如有疑问，可直接向我提供案件细节，我将为您详细解答。