当员工不能胜任工作时，关于赔偿的问题，这主要取决于用人单位的处理方式以及是否遵循了相关法律法规。以下是一个详细且深入的解答：
一、合法调岗与解除劳动合同的情况
调岗的合法性：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十五条，用人单位与劳动者协商一致才能变更劳动合同的内容，包括工作岗位。若员工不能胜任原岗位，用人单位可以与其协商调岗。
- 如果调岗是合法且合理的，比如新岗位与员工技能相匹配，工作环境无显著变化，且经过员工同意，那么通常不会产生额外的补偿。
解除劳动合同的合法性：
- 依据《中华人民共和国劳动合同法》第四十条第二项，若员工不能胜任工作，经过培训或调整岗位后仍不能胜任，用人单位可提前三十日以书面形式通知劳动者本人或者额外支付一个月工资后解除劳动合同。
- 在此情况下，用人单位应当向劳动者支付经济补偿。经济补偿的计算方式是：按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，支付半个月工资的经济补偿。月工资指的是劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资。
二、不合法调岗的后果
调岗的不合理性：
- 如果调岗不具备合理性，比如工作内容与员工技能严重不匹配、工作环境明显恶劣等，或者未经过协商一致，或者存在歧视、违法目的，那么这种调岗是不合法的。
- 在不合法调岗的情况下，如果员工被迫离职或被解除劳动合同，用人单位需要支付赔偿金。
赔偿金的计算：
- 赔偿金的标准通常是经济补偿标准的二倍。即按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付两个月工资的标准向员工支付。
三、赔偿方式与途径
协商解决：
- 用人单位和劳动者可以就赔偿事宜进行协商，达成一致意见后签订协议。
申请劳动仲裁：
- 如果协商不成，劳动者可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求用人单位支付经济补偿金和/或代通知金（如果用人单位选择额外支付一个月工资解除劳动合同）。
提起诉讼：
四、员工的注意事项
证据收集：
- 员工应收集能证明自身不能胜任原岗位工作、调岗相关通知、调岗后工作表现及调岗不合理性等方面的证据。这些证据在后续的劳动仲裁或诉讼中可能起到关键作用。
了解法律程序：
- 员工应了解并遵循相关的法律程序，确保自己的诉求得到合法有效的支持。比如，在申请劳动仲裁前，需要确保已经经过了协商等前置程序。
综上所述，当员工不能胜任工作时，赔偿问题主要取决于调岗的合法性、合理性以及劳动合同的具体约定。用人单位在调岗和解除劳动合同时，应严格遵守相关法律法规，确保员工的合法权益得到保障；而员工也应积极收集证据，通过合法途径维护自己的权益。