针对刷单公司钱被员工卷跑的情况，公司应迅速采取以下措施来维护自身权益：
立即报警并启动内部调查
- 员工卷款逃跑可能涉嫌职务侵占罪或诈骗罪，公司应第一时间向当地公安机关报案，详细说明案件情况，并提供相关证据。
- 同时，公司应启动内部调查，核实被卷走的具体金额、涉及的业务项目以及员工在卷款前后的行为表现。
收集与保留证据
- 公司应尽快收集所有与员工及事件相关的证据，包括但不限于劳动合同、交易记录、聊天记录、转账凭证、监控录像等。
- 这些证据将有助于明确员工职责、货款流向以及事件全貌，为后续的法律程序提供有力支持。
尝试沟通与联系
- 在报警和收集证据的同时，公司应尝试通过多种方式与员工取得联系，要求其说明货款去向并限期归还。
- 如果无法直接联系到员工，公司可以考虑与其家属沟通，希望家属能够协助寻找并督促员工归还货款。
法律途径解决
- 刑事诉讼：公司可以向公安机关提交证据材料，要求追究员工的刑事责任。如果员工被认定构成职务侵占罪或诈骗罪，将面临刑事处罚。
- 民事诉讼：公司还可以根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，向公司所在地或员工住所地的人民法院提起诉讼，要求员工返还被侵占的货款并赔偿经济损失。在诉讼过程中，公司应充分利用收集到的证据，确保诉讼请求得到法院的支持。
依据公司规章制度处罚
- 如果公司内部有明确的规章制度对挪用货款等行为进行规定，公司可以依据这些规章制度对员工进行处罚，如开除、罚款等。
- 这不仅是对违规行为的惩戒，也是对公司内部管理制度的强化和执行。
防范后续风险
- 公司应完善财务管理制度，加强财务监督与审计，确保资金安全。
- 实行双人操作制度，定期对员工进行岗位轮换，降低单一员工掌握过多资金或信息的风险。
- 加强员工背景调查，包括工作经历核实、犯罪记录查询等，确保招聘到诚信可靠的员工。
- 提高员工的法律意识和职业道德水平，通过培训和教育降低类似事件发生的风险。
在处理此类事件时，公司还需注意以下几点：
- 保持冷静与理智：面对员工卷款逃跑的情况，公司应保持冷静与理智，避免采取过激或违法的行为。
- 及时咨询专业律师：虽然我在这里提供了一些基本的法律建议，但每个案件的具体情况都有所不同。因此，公司在处理此类事件时，应及时咨询专业律师，以便获得更具体、更专业的法律指导。
- 积极配合调查：公司应积极配合公安机关的调查工作，提供必要的证据和信息，以便尽快查明事实真相并追回损失。
最后，我想强调的是，预防总是优于治疗。公司应建立健全的内部管理制度，加强对员工的监督和培训，提高风险防范意识。通过这些措施的实施，可以有效降低类似事件的发生概率，并为公司创造更加安全、稳定的经营环境。如果公司有任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。