在工程合同纠纷案件中，若原法人去世，可按以下方式处理：

1. 公司主体资格与责任承担
   首先需明确，法人去世不影响公司作为独立法律主体的资格。根据《公司法》第三条，公司是企业法人，有独立的法人财产，享有法人财产权，公司以其全部财产对债务承担责任。因此，原法人去世后，工程合同纠纷的诉讼或责任承担主体仍为公司本身，而非原法人个人。

2. 原法人遗产与债务的区分
   若纠纷涉及原法人个人财产（如以个人名义签署合同、提供担保或个人财产与公司财产混同），则需区分公司债务与个人债务：

   • 公司债务：由公司继续承担，原法人去世不改变债务归属。
     
   • 个人债务：需通过继承程序处理。根据《民法典》第一千一百六十一条，继承人以所得遗产实际价值为限清偿被继承人依法应当缴纳的税款和债务。若继承人放弃继承，则对公司债务无清偿义务。

3. 诉讼程序中的主体变更
   若原法人作为诉讼当事人（如原告或被告），其去世后需依法变更诉讼主体：

   • 原告去世：若原告为原法人个人，需由其继承人表明是否参加诉讼；若原告为公司，则由公司继续作为诉讼主体。
     
   • 被告去世：若被告为原法人个人，法院会通知其继承人作为当事人承担诉讼；若被告为公司，则公司仍为适格被告。
     操作建议：及时向法院提交原法人死亡证明、亲属关系证明及继承人身份信息，申请变更诉讼主体。

4. 实际控制人或股东的责任
   若原法人同时为公司股东或实际控制人，需审查是否存在滥用法人独立地位逃避债务的情形。根据《公司法》第二十条，若股东滥用权利损害债权人利益，需对公司债务承担连带责任。例如：

   • 财产混同（如公司资金与个人账户频繁往来）；
     
   • 过度支配与控制（如随意调配公司资产）；
     
   • 资本显著不足（如注册资金未实缴且与公司规模不匹配）。
     提示：若存在上述情形，可追加股东或实际控制人为共同被告。

5. 实务建议

   • 证据固定：收集合同、付款记录、沟通记录等证据，证明债务与公司相关；
     
   • 财产保全：若担心公司转移财产，可申请法院冻结公司账户或查封等值财产；
     
   • 协商调解：优先通过协商解决，降低诉讼成本和时间成本；
     
   • 继承程序跟进：若涉及个人债务，需关注继承人是否放弃继承或遗产分配情况。

总结：原法人去世不影响公司作为合同纠纷主体的资格，但需根据债务性质（公司债务或个人债务）采取不同策略。若涉及个人债务，需通过继承程序追偿；若涉及公司债务，可直接向公司主张权利，并关注是否存在股东滥用权利的情形。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作细节。