结论：针对您提出的“缺卡算旷工加班不给加班费如何仲裁”的问题，您可以通过准备充分的证据材料，向劳动争议仲裁委员会提起仲裁申请，要求确认公司缺卡算旷工的规定违法，并支付应得的加班费。以下是详细的分析和建议：

一、法律背景与依据

1. 旷工认定：旷工通常指的是员工无正当理由未到岗工作。公司若将缺卡直接等同于旷工，需要明确这一规定在劳动合同或公司规章制度中有明确约定，并且该约定不违反法律法规的强制性规定。若公司无法证明这一点，其缺卡算旷工的规定可能被视为违法。

2. 加班费支付：根据《劳动法》和《劳动合同法》的相关规定，员工在法定工作时间以外加班的，公司应当支付加班费。加班费的具体标准根据加班时间和加班性质的不同而有所差异。

二、仲裁准备与流程

1. 收集证据：

   • 缺卡记录：收集您缺卡的具体记录，包括缺卡日期、时间等，以证明您并非无故缺勤。
   • 加班证据：收集您加班的证据，如加班申请单、加班通知、工作记录等，以证明您确实存在加班事实。
   • 公司规章制度：获取公司的规章制度，特别是关于缺卡和旷工的规定，以分析其合法性。
   • 工资条和银行流水：收集您的工资条和银行流水，以证明公司未支付加班费的事实。

2. 撰写仲裁申请书：

   • 明确仲裁请求：包括确认公司缺卡算旷工的规定违法、支付应得的加班费等。
   • 陈述事实和理由：详细陈述您缺卡和加班的情况，以及公司未支付加班费的事实和理由。
   • 提供证据材料：将收集到的证据材料作为仲裁申请书的附件一并提交。

3. 提交仲裁申请：

   • 将仲裁申请书和相关证据材料提交给当地的劳动争议仲裁委员会。
   • 等待仲裁委员会的受理和开庭通知。

4. 参加仲裁庭审：

   • 在仲裁庭审中，按照仲裁员的指示进行陈述、举证和质证。
   • 积极回应公司的答辩和反驳，维护自己的合法权益。

三、可能遇到的法律后果与应对策略

1. 公司否认加班事实：

   • 若公司否认您存在加班事实，您需要提供充分的证据来证明自己的加班情况。
   • 可以邀请同事作为证人出庭作证，或者提供其他间接证据来支持自己的主张。

2. 公司主张缺卡即旷工：

   • 若公司主张缺卡即旷工，并据此拒绝支付加班费，您需要分析公司规章制度中关于缺卡和旷工的规定是否合法。
   • 若公司规章制度违法，您可以要求仲裁委员会确认其无效，并据此要求公司支付加班费。

四、建议与提醒

1. 及时咨询与行动：若您遇到此类问题，建议及时咨询专业律师（即我本人，贺晶晶律师，专注于婚姻家庭、刑事辩护、经济纠纷、合同纠纷、交通事故、劳动仲裁领域），以便更好地了解自己的权益和维权途径。同时，也要尽快采取行动，避免超过仲裁时效。

2. 保留证据：在日常生活中，要注意保留与工作相关的证据材料，如加班申请单、工作记录、工资条等。这些证据材料在维权过程中将起到至关重要的作用。

3. 理性维权：在维权过程中，要保持理性态度，避免采取过激行为。通过合法途径维护自己的权益是最佳选择。

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