结论：个体工商户项目经理拿走350万工程款的行为，是否构成侵占罪，需结合具体情况判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：
一、侵占罪的构成要件
侵占罪，是指以非法占有为目的，将他人的交给自己保管的财物、遗忘物或者埋藏物非法占为己有，数额较大，拒不交还的行为。其构成要件主要包括：
- 主体要件：行为人需为代为保管他人财物的人或拾得他人遗忘物、埋藏物的人。
- 主观要件：行为人必须具有非法占有的目的。
- 客体要件：行为侵犯的是他人财物的所有权。
- 客观要件：行为人实施了将代为保管的他人财物、遗忘物或者埋藏物非法占为己有，数额较大，拒不交还的行为。
二、项目经理拿走工程款的行为分析
项目经理的身份与职责：
- 项目经理作为个体工商户的负责人或管理者，通常负责工程款的收支管理。但关键在于，工程款是否属于项目经理个人所有或其是否有权单独支配。
- 若工程款属于个体工商户的财产，项目经理仅负责管理而非所有，则其无权擅自拿走。
非法占有的目的：
- 项目经理拿走工程款时，是否具有非法占有的目的，即是否意图将工程款据为己有，而非用于个体工商户的经营或支付相关费用。
- 这需要通过项目经理的行为、言辞、资金流向等证据来综合判断。
数额与拒不交还：
- 侵占罪要求数额较大，且拒不交还。350万通常属于数额较大的范畴。
- 若项目经理在拿走工程款后，经个体工商户或相关权利人要求，仍拒不交还，则符合侵占罪的客观要件。
三、可能的其他罪名
若项目经理的行为不符合侵占罪的构成要件，但存在其他违法行为，如挪用资金、职务侵占（若项目经理被视为公司、企业或其他单位的人员）等，则可能构成其他罪名。这需要根据项目经理的具体身份、行为性质以及相关法律法规进行综合判断。
四、法律建议
- 收集证据：个体工商户应尽快收集与项目经理拿走工程款相关的证据，如合同、账目、转账记录、项目经理的言辞等。
- 咨询律师：由于刑事案件的复杂性和专业性，建议个体工商户尽快咨询专业律师，以便更准确地判断项目经理的行为性质，并采取相应的法律措施。
- 报警处理：若认为项目经理的行为构成犯罪，个体工商户可以向公安机关报案，由公安机关进行调查取证，并依法处理。
总结：个体工商户项目经理拿走350万工程款的行为是否构成侵占罪，需结合项目经理的身份、职责、非法占有的目的、数额以及拒不交还等要素进行综合判断。若构成侵占罪或其他犯罪，个体工商户应尽快收集证据、咨询律师并报警处理。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。