违反公平竞争审查标准的文件原则上不能执行，但需分情况讨论：

1. 文件尚未产生实际效力或未对外公布
   若文件仅处于内部起草、审议阶段，尚未正式发布或对外产生约束力，则因其违反公平竞争审查标准，应当立即停止推进程序，不得继续执行。根据《公平竞争审查制度实施细则》规定，政策制定机关需在文件出台前完成审查，未通过审查的文件不得出台。此时文件因未满足合法性要件，自始不具有执行力。

2. 文件已发布但尚未造成实际影响
   若文件已对外公布但尚未实施（如未进入执行阶段、未对市场主体产生实际约束），政策制定机关应主动撤销或修改文件，消除违法状态。根据《反垄断法》及公平竞争审查制度要求，此类文件因违反“不得限制市场准入退出”“不得限制商品自由流通”等审查标准，自始无效，不得作为行政行为的依据。

3. 文件已实施并产生实际影响
   若文件已执行并导致市场主体权益受损（如限制竞争、排除竞争对手），则需分两步处理：

   • 立即停止执行：政策制定机关应第一时间终止文件效力，避免损害扩大；
     
   • 启动救济程序：受影响的市场主体可依据《反垄断法》向市场监管部门举报，或通过行政诉讼主张文件违法并请求赔偿。此时文件虽已执行，但因其违法性，执行行为不产生合法效力，相关行政行为可能被确认违法或撤销。

特殊情形：若文件涉及国家安全、社会公共利益等例外情形，且已按《公平竞争审查制度实施细则》完成例外情形说明并报备，则可能被允许执行。但此类情形需严格满足“对实现政策目的不可或缺”“不会严重限制市场竞争”等条件，且需经上级机关或反垄断执法机构审查同意。

建议：若您发现某文件涉嫌违反公平竞争审查标准，可先通过政府公开渠道查询其审查流程记录；若已造成损害，建议收集证据（如文件文本、执行通知、损失证明等）并向我进一步咨询，我将协助您分析具体维权路径。