复议机关在收到申请人的证据后，会通过综合审查判断其真实性、合法性与关联性，并非仅依赖自行判断，而是结合多种方式。具体审查方式如下：

1. 真实性审查
   复议机关会通过核对证据原件、要求申请人补充说明或提供佐证材料、对证据形成过程进行调查等方式，判断证据是否客观存在且未被篡改。例如，对书面证据的笔迹、印章真伪进行鉴定，或通过询问证人、调取监控录像等核实事实经过。若证据涉及第三方机构出具的材料（如鉴定报告），复议机关可能直接向该机构核实其真实性。

2. 合法性审查
   复议机关会审查证据的取得方式是否符合法定程序。例如，若证据是通过行政机关调查收集的，需核查是否遵循了《行政处罚法》《行政强制法》等规定的程序（如是否出示证件、是否告知权利等）；若证据是申请人自行收集的，需审查是否存在侵犯他人合法权益的情形（如非法侵入住宅、窃听等）。若证据来源违法，即使内容真实，也可能被排除。

3. 关联性审查
   复议机关会判断证据与待证事实之间是否存在逻辑联系。例如，在行政处罚复议案件中，若申请人提交的证据是其他案件的处罚决定书，复议机关会审查该证据是否能证明当前案件中行政行为的合法性或合理性。若证据与案件核心争议无关（如提交与案件无关的个人隐私材料），则可能被认定为不具有关联性。

审查方式的具体操作：
复议机关的审查并非仅依赖“自行判断”，而是通过以下方式综合认定：

• 要求申请人补充说明：对证据存在疑问时，可要求申请人进一步解释证据来源、形成过程或与案件的关联性。
  
• 依职权调查取证：根据《行政复议法》第41条，复议机关可向有关单位或个人调查取证，查阅、复制、调取有关文件和资料，甚至委托鉴定机构对专门性问题进行鉴定。
  
• 组织听证或质证：对重大、复杂案件，复议机关可组织听证，由申请人和被申请人当面质证，通过交叉询问、辩论等方式核实证据。
  
• 参考司法实践或专家意见：对专业性较强的证据（如医疗鉴定、技术检测报告），复议机关可能参考同类司法案例或咨询相关领域专家。

总结：复议机关对证据的审查是系统性、多维度的工作，既包括对证据本身的直接审查，也包括通过调查、听证等程序间接核实，最终综合判断证据是否符合真实性、合法性与关联性要求。若您有具体案件中的证据审查问题，可直接向我咨询，我会结合案件细节进一步分析。