针对您提出的“公司给员工工资发两次怎么处理”的问题，这实际上可能涉及两种不同的情况：一是公司误发了两次工资；二是公司出于某种原因（如合理避税、资金安排等）选择将工资分两次发放。下面我将分别就这两种情况给出详细的解答。
一、公司误发了两次工资
核实情况：
- 首先，您应仔细查看工资条和银行流水，确认两次发放的工资是否均为同一月份或同一项目的工资。
- 接着，与公司财务或人力资源部门沟通，了解具体的工资构成和发放明细，以确定是否存在误发的情况。
应对措施：
- 如果确认是误发，您应立即与公司联系，说明情况并告知多发工资的问题。保留好相关聊天记录或通话录音作为证据。
- 根据公司要求，按照规定的程序和方式退还多发的工资。退还后，要求公司出具收款凭证或确认函，以证明您已履行退还义务。
法律后果：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，得利人没有法律根据取得不当利益的，受损失的人可以请求得利人返还取得的利益。因此，若您在知晓工资多发且属于误发的情况下拒绝退还，公司有权通过法律途径要求返还。
- 若涉及金额较大，且经公司催告后仍拒不退还，还可能涉嫌侵占罪，面临刑事处罚。
二、公司选择将工资分两次发放
合法性分析：
- 公司工资分两次发是否合法，主要取决于公司与员工是否就此达成了明确协议，并且该做法不违反相关法律法规的强制性规定。
- 如果公司与员工在劳动合同中明确约定了工资分两次发放的时间、金额等具体细节，且每次发放的金额都不低于当地最低工资标准，那么这种做法是合法的。
可能带来的影响：
- 员工权益：工资分两次发放可能影响经济补偿的计算基数，导致劳动者在解除或终止劳动合同时获得的经济补偿金额减少。同时，工资流水不清晰也可能影响贷款、信用卡等信用业务的审批。
- 税务与社保：分两次发放工资可能有助于员工享受税务优惠，但也可能因降低单次发放金额而影响实际收入。此外，工资总额是计算社保缴费基数的基础，分两次发放可能影响员工的社保待遇和福利水平。
应对建议：
- 对于劳动者：仔细阅读劳动合同和公司工资制度，了解工资的构成、发放方式和时间。对工资发放有疑问时，及时与公司沟通并要求解释说明。保存与工资发放相关的证据，如银行流水、工资条等。
- 对于用人单位：制定明确的工资制度，并确保其合法性和合理性。规范工资发放流程，尽量通过银行转账等方式发放，并提供详细的工资条。遵守法律法规和劳动合同约定，确保员工的合法权益得到保障。在考虑分两次发放工资时，需全面评估其对员工权益、税务、社保等方面的影响，并确保合规性。
综上所述，针对公司给员工工资发两次的问题，您应首先核实情况，确定是误发还是公司有意为之。如果是误发，应及时退还；如果是公司有意为之且合法合规，则应了解其可能带来的影响并做好相应准备。