结论：面对上司故意将绩效打得很差从而影响年终奖的情况，你可以从收集证据、与公司沟通协商、寻求内部救济途径、申请劳动仲裁以及提起诉讼等多个角度来维护自己的合法权益。

1. 收集证据

• 绩效评估记录：保留所有与绩效评估相关的文件，包括但不限于绩效评估表、上司的评语、评分标准等。这些文件将作为证明上司故意打低绩效的关键证据。
• 工作表现证明：收集能够证明你工作表现良好的证据，如项目成果、客户反馈、同事评价等。这些证据有助于反驳上司的不合理评估。
• 沟通记录：如果与上司就绩效评估问题进行过沟通，保留相关的沟通记录，如邮件、短信、聊天记录等。这些记录可能揭示上司的动机或态度。

2. 与公司沟通协商

• 提出异议：在收到绩效评估结果后，及时向上司或人力资源部门提出异议，并说明你认为评估不公正的理由。
• 要求复核：如果公司设有绩效评估复核机制，可以要求进行复核，并提供你收集的证据来支持你的观点。

3. 寻求内部救济途径

• 工会介入：如果公司设有工会，可以向工会反映情况，请求工会协助解决争议。工会可能会组织调解或提供法律援助。
• 内部投诉：根据公司内部的规章制度，向更高层级的管理人员或相关部门进行投诉，寻求内部解决。

4. 申请劳动仲裁

• 准备材料：如果内部救济途径无法解决问题，你可以准备相关材料，如仲裁申请书、证据清单、身份证复印件等，向当地劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
• 仲裁请求：在仲裁申请中，明确你的请求，如要求公司重新评估绩效、补发年终奖等。
• 仲裁过程：参加仲裁庭审，提供证据，陈述事实和理由，维护自己的合法权益。

5. 提起诉讼

• 诉讼准备：如果对仲裁结果不满意，你可以在收到仲裁裁决书之日起十五日内向人民法院提起诉讼。在诉讼前，准备好起诉状、证据材料等。
• 诉讼过程：在诉讼过程中，你需要出庭参加庭审，提供证据，接受法庭调查和辩论。法院将根据事实和法律规定作出判决。

法律背景与建议：

• 根据《中华人民共和国劳动法》和相关规定，劳动者有权获得公正的绩效评估和相应的报酬。上司故意打低绩效并影响年终奖的行为可能构成违法行为。
• 在处理此类纠纷时，建议保持冷静和理性，通过合法途径维护自己的权益。避免采取过激行为或言语攻击，以免加重纠纷或承担不必要的法律责任。
• 如果对法律程序不熟悉或感到困惑，可以寻求专业律师的帮助。作为专业律师，我可以为你提供详细的法律咨询和代理服务，帮助你更好地维护自己的合法权益。

可能法律后果：

• 如果经过调查和仲裁/诉讼程序，确认上司存在故意打低绩效的行为，公司可能需要重新评估你的绩效并补发年终奖。
• 如果上司的行为构成违法或违反公司规章制度，公司还可能对上司进行相应的处罚或处理。