公司以经营困难为由拖欠员工工资是违法的。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
一、法律依据与违法性
根据《中华人民共和国劳动法》第五十条的规定：“工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。”这意味着，无论公司经营状况如何，都应当按时足额支付员工工资，不得以任何理由拖欠。因此，公司以经营困难为由拖欠工资，违反了上述法律规定，是违法的。
二、员工权益与维权途径
了解自身权益：员工应明确自己享有按时足额获得工资的权利，这是法律赋予的基本权益。
优先协商解决：在发现公司拖欠工资时，员工可以首先尝试与公司进行协商，了解拖欠的具体原因，并尝试达成还款协议。如果双方能够达成一致，建议以书面形式签订协议，明确支付金额、方式和时间。
向劳动监察部门投诉：如果协商无果，员工可以向当地劳动监察大队进行投诉，反映公司拖欠工资的问题。投诉时需提供相关证据，如劳动合同、工资条、考勤记录等。劳动监察部门将对公司进行调查核实，若查证属实，将责令公司限期支付拖欠工资，并可加付赔偿金。
申请劳动仲裁或调解：若投诉仍未解决问题，员工可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。在申请仲裁前或仲裁过程中，员工也可以考虑向调解组织申请调解，以寻求更快速的解决方案。仲裁委员会将根据双方提供的证据和法律规定作出裁决。若公司拒不执行裁决，员工可向法院申请强制执行。
提起诉讼：若对仲裁裁决不服，员工可在收到裁决书后15日内向人民法院提起诉讼。法院将受理案件并进行审理，最终作出判决。若公司仍不履行判决，员工可通过法院强制执行程序追讨工资。
三、特殊情况下的工资支付
如果公司确实因经营困难而无法支付工资，且已经进入破产程序，员工的工资等权益仍然受到法律保护。根据《中华人民共和国企业破产法》的相关规定，债务人所欠职工的工资和医疗、伤残补助、抚恤费用等不必申报，由管理人调查后列出清单并予以公示。在企业破产清算中，员工的工资等权益将作为优先债权得到清偿。
四、建议与提醒
保留证据：员工应妥善保管所有与拖欠工资相关的证据材料，如劳动合同、工资条、考勤记录、沟通记录等，以便在需要时使用。
及时维权：一旦发现公司拖欠工资，员工应及时采取行动，通过协商、投诉、仲裁或诉讼等途径维护自己的合法权益。拖延时间可能会使维权变得更加困难。
寻求法律援助：在整个维权过程中，员工可以寻求法律援助机构的帮助，获取法律咨询和代理服务。这将为员工提供专业的法律支持和建议。
综上所述，公司以经营困难为由拖欠员工工资是违法的。员工应了解自己的权益和维权途径，及时采取行动维护自己的合法权益。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。