在签合同与实际履行合同主体不一致的情况下，如何列被告，主要取决于具体的法律关系和事实情况，以下是一些常见的情况及对应的被告确定方式：
合同相对性原则下的被告确定：
- 根据合同相对性原则，合同一般只对签订合同的双方当事人产生法律约束力。因此，在大多数情况下，如果合同是由A公司与B公司签订，但实际履行的是A公司与C公司，那么从合同法律关系的角度来看，B公司仍然是合同的一方当事人，如果发生纠纷，B公司通常会被列为被告。
- 例外情况：如果C公司以自己的名义实际履行了合同，并且得到了B公司的明确认可或追认，或者存在表见代理等情形，使得A公司有理由相信C公司有权代表B公司履行合同，那么在这种情况下，C公司也可能被视为合同的一方当事人，从而有可能被列为共同被告或单独被告，具体取决于案件的具体情况和法院的认定。
实际履行行为对被告确定的影响：
- 如果实际履行行为构成了对原合同的变更或补充，并且这种变更或补充得到了合同双方的明确同意，那么在实际履行主体与合同签订主体不一致的情况下，可能需要考虑将实际履行主体也列为被告，特别是当实际履行行为与合同纠纷有直接关联时。
- 如果实际履行行为并未得到合同双方的明确同意，而是单方面由一方或第三方进行的，那么这种实际履行行为可能不构成对原合同的变更或补充。在这种情况下，被告的确定仍然应基于原合同的签订主体。
法律后果与责任承担：
- 在确定被告时，还需要考虑法律后果和责任承担的问题。如果实际履行主体与合同签订主体不一致，但实际履行主体在履行过程中存在过错或违约行为，导致合同另一方遭受损失，那么实际履行主体可能需要承担相应的法律责任。在这种情况下，将实际履行主体列为被告是合理的。
- 同时，如果合同签订主体在合同签订或履行过程中也存在过错或违约行为，那么合同签订主体也应承担相应的法律责任，并可能被列为共同被告。
建议：
- 在处理此类纠纷时，建议首先收集并整理所有相关的合同文件、履行凭证、沟通记录等证据材料，以便清晰地呈现合同签订与实际履行的情况。
- 咨询专业律师（即我，张翠云律师，专注于婚姻家庭、合同纠纷领域），根据案件的具体情况和证据材料，分析法律关系和责任承担问题，从而确定合适的被告。
- 在提起诉讼前，可以考虑通过协商、调解等方式解决纠纷，以节省时间和成本，并避免不必要的法律风险。
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