结论：村书记、村主任同时领取政府发放的工资和村办厂发放的工资是否合法，需根据具体情况判断，主要看是否符合相关法律法规及村集体组织的规定，一般情况下，若存在双重劳动关系且未违反相关规定，领取两份工资可能合法；但若存在违规兼职取酬或利益冲突等情况，则可能不合法。
分析说明：
双重劳动关系的合法性：
- 村书记、村主任作为村集体组织的负责人，其工资通常由政府或村集体组织根据相关规定发放。若他们在村办厂中担任实际职务（如厂长、经理等），并从事了相应的工作，且该工作与村集体组织的职务不冲突，同时村办厂也愿意支付工资，那么从劳动关系的角度来看，他们可能同时存在双重劳动关系。
- 在这种情况下，如果村办厂的工资支付符合劳动法律法规的规定（如签订了劳动合同、按时足额支付工资等），且村集体组织对此没有禁止性规定，那么他们领取两份工资可能是合法的。
违规兼职取酬的问题：
- 如果村书记、村主任在村办厂中的职务是虚构的，或者他们并未实际从事村办厂的工作，而只是以兼职的名义领取工资，那么这种行为可能构成违规兼职取酬。
- 违规兼职取酬不仅违反了村集体组织的规定，也可能触犯了相关的法律法规，如《中华人民共和国村民委员会组织法》等，这种情况下领取两份工资是不合法的。
利益冲突的问题：
- 村书记、村主任作为村集体组织的负责人，其职责是维护村集体组织的利益。如果他们在村办厂中担任职务并领取工资，而村办厂的经营活动与村集体组织的利益存在冲突，那么这种行为可能损害村集体组织的利益。
- 在这种情况下，即使他们领取两份工资的行为在形式上符合相关规定，也可能因为存在利益冲突而被视为不合法。
法律建议：
- 对于村书记、村主任来说，他们应该仔细审查自己在村办厂中的职务和工资支付情况，确保自己的行为符合相关法律法规和村集体组织的规定。
- 如果他们确实在村办厂中担任实际职务并从事了相应的工作，且该工作与村集体组织的职务不冲突，同时村办厂的工资支付也符合劳动法律法规的规定，那么他们可以依法领取两份工资。
- 如果他们存在违规兼职取酬或利益冲突的情况，那么他们应该立即停止这种行为，并主动向相关部门说明情况，以避免可能的法律责任。
后续行动建议：
- 如果您对村书记、村主任领取两份工资的行为存在疑问或担忧，建议您向当地的村集体组织、政府部门或法律机构进行咨询和举报。
- 同时，您也可以关注相关的法律法规和政策动态，以了解最新的规定和要求，从而更好地维护自己的合法权益。
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