在查办案件期间，违法人员退还违法收入并不免除对其违法所得的没收程序，两者并不冲突，通常需要并行处理。以下从不同角度进行详细分析：

1. 法律性质与目的：

   • 退还违法收入：这通常是违法人员主动或被动地将其通过违法行为获得的收入返还给受害者或相关机构，旨在恢复受害者的经济损失，体现的是对受害者的补偿。
   • 没收违法所得：这是法律对违法人员的一种惩罚性措施，旨在剥夺其通过违法行为获得的利益，防止其从违法行为中获利，体现的是对违法行为的制裁。

2. 法律程序与要求：

   • 退还违法收入可能是在案件调查过程中，违法人员为了减轻处罚或表现悔过态度而主动进行的，也可能是法院或执法机构根据案件情况要求其进行的。
   • 没收违法所得则是法律明确规定的程序，通常需要在法院判决或行政处罚决定中明确，并由执法机构负责执行。即使违法人员已经退还了违法收入，如果法律认为需要没收其违法所得，仍然会进行没收程序。

3. 实际操作中的考量：

   • 在实际操作中，执法机构或法院会综合考虑违法行为的性质、情节、后果以及违法人员的态度等因素，来决定是否需要没收违法所得。
   • 如果违法人员已经退还了全部或大部分违法收入，且表现出真诚的悔过态度，执法机构或法院可能会在没收违法所得时给予一定的考虑或减轻处罚。但这并不意味着可以免除没收程序，而是可能在没收金额或方式上有所调整。

4. 法律后果与影响：

   • 如果违法人员未退还违法收入且未被没收违法所得，其可能面临更严重的法律后果，包括更重的罚款、更长的监禁期限等。
   • 即使违法人员已经退还了违法收入，但如果未被没收违法所得，其仍然可能被视为从违法行为中获得了利益，这可能影响其未来的信用记录、社会评价等。

建议：

• 对于违法人员而言，在查办案件期间，应积极配合执法机构或法院的工作，主动退还违法收入，并表现出真诚的悔过态度。
• 同时，应了解并遵守相关法律法规，明确自己的权利和义务，避免因为对法律程序的不了解而遭受不必要的损失。
• 如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我将根据具体情况提供专业的法律意见。