结论：综合工时制下，公司减少工时导致工资减少但不低于当地最低工资标准的，是否合法需分情况讨论。以下是具体分析：

合法情形

1. 协商一致并书面确认

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十五条，用人单位与劳动者协商一致，可以变更劳动合同约定的内容，包括工作时间和薪酬待遇。若公司因经营需要调整工时，且与员工进行了充分协商，双方达成一致意见，并采用书面形式对变更内容进行确认，则这种调整是合法的。
   • 关键点：协商一致、书面确认、降低后的工资不低于当地最低工资标准。

2. 特殊工时制度的批准

   • 对于因生产特点不能实行标准工时制度的企业，如采用综合工时制，可以根据《中华人民共和国劳动法》第三十九条，经劳动行政部门批准，实行其他工作和休息办法。若公司已获得相关批准，并在法律允许的范围内调整工时，且确保员工工资不低于最低标准，则这种调整也是合法的。
   • 关键点：劳动行政部门批准、法律允许范围内、工资不低于最低标准。

3. 经济性裁员程序中的调整

   • 在符合《中华人民共和国劳动合同法》第四十一条规定的情形下，如企业重整、生产经营困难等，企业可以通过减少工时降低工资的方式来共渡难关。但此过程中必须遵循法定程序，包括提前向工会或全体职工说明情况、听取意见、裁减人员方案经向劳动行政部门报告等。若公司遵循了这些程序，且调整后的工资不低于最低标准，则这种调整是合法的。
   • 关键点：符合法定情形、遵循法定程序、工资不低于最低标准。

不合法情形

1. 未经协商擅自变更

   • 若公司未与员工进行协商，或虽进行了协商但员工不同意，单方面决定减少工时并降低工资，则违反了《中华人民共和国劳动合同法》的规定。这种行为构成违约，员工有权要求公司按照原劳动合同的约定提供劳动条件和支付工资。
   • 关键点：未经协商、单方面决定、违反劳动合同约定。

2. 降低工资幅度不合理

   • 即使公司有合理理由减少工时，但降低工资的幅度超过了合理范围，也可能被认定为不合法。公司需要证明降低工资的合理性和必要性，且降低后的工资应能保障员工的基本生活。若公司无法证明这一点，则这种调整是不合法的。
   • 关键点：降低幅度不合理、无法证明合理性和必要性、无法保障基本生活。

3. 违反劳动合同约定

   • 如果公司减少工时降低工资的行为违反了劳动合同的明确约定，员工可以依据劳动合同向公司主张权利。员工可以要求公司恢复原状或给予相应的经济补偿。
   • 关键点：违反劳动合同约定、员工有权主张权利。

员工维权途径

面对公司不合理地减少工时降低工资的行为，员工可以采取以下途径维护自己的合法权益：

1. 与公司友好协商：首先尝试与公司进行沟通，表达自己的诉求和立场，寻求双方都能接受的解决方案。
2. 向劳动监察部门投诉：如果协商无果，可以向当地的劳动监察部门投诉，由劳动监察部门介入调查并处理。
3. 申请劳动仲裁：在必要时，员工可以向劳动仲裁机构申请劳动仲裁，通过法律途径来维护自己的权益。劳动仲裁机构将依法进行裁决，要求公司承担相应的法律责任。

建议：若您遇到此类情况，建议首先与公司进行友好协商，了解公司调整工时的具体原因和依据。若协商无果，且您认为公司的行为违反了相关法律法规或劳动合同约定，可以向当地的劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。