针对您提出的问题，即员工一个月有三天带薪休假，但一个月只上了三天班时工资应如何计算，以下是我的详细解答：

首先，我们需要明确的是，员工每月享有的三天带薪休假是公司给予员工的福利，这三天休假期间，员工的工资是正常发放的，不会影响其月薪总额。这是基于劳动法对于员工休息休假权益的保护，也是公司规章制度中通常会明确的内容。

接下来，我们具体分析工资的计算方式：

1. 日工资标准的确定：

   • 日工资通常是通过员工的月工资除以月计薪天数（一般为21.75天，这是根据国家规定的工作日和休息日计算得出的平均值）来确定的。例如，如果员工的月工资是5000元，那么其日工资大约是229.89元。

2. 带薪休假期间的工资支付：

   • 在员工享受三天带薪休假期间，公司需要按照员工的日工资标准正常支付工资。也就是说，这三天员工虽然未出勤，但其工资收入与正常出勤时是一样的。

3. 实际出勤与休假的关系：

   • 在您提到的情境中，员工一个月只上了三天班，但享受了三天带薪休假。这并不意味着员工的工资会受到影响或减少。因为带薪休假本身就是公司给予员工的福利，不因其实际出勤天数的减少而改变。

4. 出勤考核与全勤奖：

   • 在计算员工当月出勤情况时，这三天带薪休假是不计入缺勤天数的。因此，即使员工只上了三天班并享受了三天带薪休假，只要其满足公司全勤奖的其他条件（如无迟到、早退等），仍应视为全勤并享受全勤奖。

5. 特殊情况的处理：

   • 如果员工在月初或月末入职/离职，或者休假期间遇到法定节假日等特殊情况，公司应根据实际情况和规章制度调整薪资和休假安排。但无论如何调整，都应确保员工的合法权益不受侵害。

综上所述，当员工一个月有三天带薪休假但只上了三天班时，其工资应按照正常出勤时的标准计算并支付。带薪休假是公司给予员工的福利，不应因其实际出勤天数的减少而受到影响。同时，公司在制定和执行休假政策时也应确保合法性和公平性，以维护员工的合法权益和公司的良好形象。