针对您提出的“员工不经过同意离职怎么处理”的问题，这是一个涉及劳动法和企业管理的重要议题。以下是我为您提供的详细解答：
首先，我们需要明确“自动离职”与合法解除劳动合同的区别。根据相关法律法规，自动离职通常指的是劳动者在未履行解除劳动合同手续或未获得用人单位批准的情况下，擅自离开工作岗位。这种行为，在不符合法定无需事先告知用人单位的情形下，可能被视为违法解除劳动合同，劳动者可能需要承担相应的赔偿责任。
对于员工不经过同意离职的情况，用人单位可以采取以下步骤进行处理：
- 确认自动离职事实：
- 用人单位应首先确认员工是否有离开企业且在规定时限内不愿回企业的主观意愿。
- 检查员工是否未履行相关手续或虽履行了手续但未经企业批准。
- 确认员工是否超过了规定的时限未归。
在此过程中，用人单位需要承担举证责任，证明员工确实存在自动离职的行为。这通常可以通过提供制作完备的考勤表、员工离职申请记录（如有）、工作交接记录等证据来实现。
审查用人单位解除劳动合同的合法性：
- 如果用人单位决定按自动离职处理员工，需要审查本单位劳动规章制度中关于自动离职和解除劳动合同的相关规定。
- 确认这些规章制度是否经过民主制定程序，是否已公示或告知劳动者，以及内容是否合法。
- 用人单位解除劳动合同的决定应当已告知工会（如有），并送达至劳动者。
考虑劳动者权益与用人单位利益的平衡：
- 在处理自动离职事件时，用人单位既要保护自身合法权益，防止员工违法行为给企业带来损失，也要考虑劳动者的权益，避免过度惩罚或不当处理。
- 如果员工自动离职给用人单位造成了实际损失，用人单位可以依据劳动合同法第九十条的规定要求劳动者赔偿损失。
- 同时，用人单位也应反思自身管理是否存在问题，如是否提供了足够的职业发展机会、是否建立了良好的沟通机制等，以减少员工自动离职的风险。
采取后续措施：
- 对于自动离职的员工，用人单位可以按照本单位劳动规章制度的规定进行处理，如扣除未发放的工资、奖金等（需符合法律法规规定）。
- 如果员工在离职后仍与用人单位存在未了结的财务或业务问题，用人单位可以通过法律途径解决。
- 用人单位还可以考虑将自动离职事件记录在员工档案中，作为未来招聘和晋升的参考。
此外，我还想提醒您，如果员工不经过同意离职是因为用人单位存在违法行为（如未依法缴纳社会保险费、未提供劳动保护等），员工有权解除劳动合同并要求用人单位支付经济补偿金。因此，用人单位在处理自动离职事件时，也应审视自身是否存在违法行为，并及时纠正。
希望以上解答能对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的法律建议，请随时咨询。