核心结论：三方协议的生效需满足协议约定的全部生效条件，若协议明确约定“三方签字/盖章后生效”且未实际履行，则学校未盖章时协议未生效；若协议无特殊约定或已实际履行，可能被认定为部分生效或已成立，但存在法律风险。以下从不同角度展开分析：

1. 协议生效的法定条件：意思表示一致+约定生效要件

根据《民法典》第490条，合同成立需当事人采用书面形式订立，且“自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立”。三方协议作为特殊合同，其生效需满足：

• 形式要件：若协议明确约定“三方签字/盖章后生效”（常见条款），则需学校完成盖章程序，否则协议未成立；
• 实质要件：若协议未明确约定生效条件，或通过实际履行（如学生报到、用人单位安排岗位）表明三方已达成合意，可能被认定为“成立但未完全生效”，但学校未盖章仍可能导致协议存在效力瑕疵。

典型场景：若协议条款写明“本协议自三方签字盖章之日起生效”，则学校未盖章时协议未生效；若条款仅写“本协议一式三份，三方各执一份”，未明确生效时间，则需结合履行情况判断。

2. 学校未盖章的法律后果：协议效力存疑，风险分配需明确

• 对学生：若协议未生效，学生可能无法依据协议主张违约金、岗位安排等权利，但若已实际入职，可能被认定为“事实劳动关系”，需通过《劳动合同法》主张权益；
• 对用人单位：若协议未生效，用人单位可能无法要求学生履行约定服务期或支付违约金，但若已提供培训等福利，可能需通过其他法律途径（如不当得利）主张补偿；
• 对学校：学校未盖章可能涉及就业指导程序瑕疵，但一般不直接承担法律责任，除非因学校过错导致学生或用人单位损失（如未及时盖章导致学生错过其他就业机会）。

风险提示：若协议中约定“学校盖章仅为备案，不影响协议效力”，则可能被认定为学校未盖章不影响生效，但此类条款需明确写入协议且不违反法律强制性规定。

3. 实务建议：分情况处理，降低法律风险

• 若协议未生效：建议三方协商补充盖章，或签订补充协议明确生效条件；若无法协商，学生可与用人单位另行签订书面协议确认权利义务；
• 若协议已部分履行：建议固定实际履行证据（如工资发放记录、考勤记录），通过书面函件要求学校补盖公章，或主张“事实合同关系”；
• 若发生纠纷：可依据《民法典》第154-156条主张协议无效（如存在欺诈、胁迫），或依据第510条主张按照合同相关条款或交易习惯确定权利义务。

总结：三方协议的效力需结合协议条款和履行情况综合判断，学校未盖章可能导致协议未生效或存在效力瑕疵。建议根据实际需求，通过补充协议、固定履行证据等方式降低风险。如有具体条款或纠纷细节，可进一步向我咨询，我会结合协议文本提供针对性建议。