事业编人员在2006年被判管制，是否会被开除，这主要取决于当时的法律法规以及单位的具体规定，但通常情况下，被判处管制是有可能面临开除的。以下从几个方面进行详细分析：
法律法规层面：
- 根据《事业单位工作人员处分暂行规定》（该规定虽非2006年直接适用，但体现了事业单位人员处分的原则和精神，且后续相关法规也延续了类似原则），事业单位工作人员被依法判处刑罚的，给予降低岗位等级或者撤职以上处分。其中，被依法判处有期徒刑以上刑罚的，给予开除处分。虽然管制不属于有期徒刑以上刑罚，但该规定也明确了“行政机关任命的事业单位工作人员，被依法判处刑罚的，给予开除处分”，且对于非行政机关任命的人员，也强调了“依法判处刑罚”的严重性，暗示了可能面临的严厉处分。
- 具体到2006年的情况，虽然当时的法律法规可能没有直接规定事业编人员被判管制必须开除，但被判处刑罚本身通常会被视为严重违反单位纪律和职业道德的行为，单位有权根据内部规定进行相应处分。
单位规定层面：
- 事业单位通常会有自己的内部规章制度，这些规章制度会明确规定员工在何种情况下会受到何种处分。如果单位的规章制度中明确规定了被判处管制等刑罚的员工将被开除，那么该员工就很有可能面临开除的处分。
- 即使单位的规章制度中没有明确规定，但考虑到被判处刑罚的严重性，单位也有可能根据内部纪律和职业道德的要求，对员工进行开除处分。
实际操作层面：
- 在实际操作中，事业编人员被判管制后是否会被开除，还会受到多种因素的影响，如员工的个人表现、单位的管理风格、社会舆论等。如果员工平时表现良好，且单位管理相对宽松，那么可能不会直接开除，而是给予其他形式的处分。但如果员工平时表现不佳，或者单位管理严格，那么开除的可能性就会大大增加。
建议：
- 对于事业编人员来说，如果面临被判管制的情况，应尽快咨询专业律师，了解自己的法律权益和可能面临的法律后果。
- 同时，也应积极与单位沟通，了解单位的具体规定和态度，以便更好地应对可能面临的处分。
- 如果认为单位的处分决定不合法或不合理，可以通过法律途径进行维权。
总结：事业编人员在2006年被判管制，是否会被开除并没有一个绝对的答案，而是取决于当时的法律法规、单位的具体规定以及实际操作中的多种因素。但无论如何，被判处刑罚都是一件严重的事情，员工应积极应对并寻求法律帮助。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。