工厂未达满勤扣底薪是否合法，需根据具体情况判断，一般而言，若劳动合同或规章制度中有明确约定且不违反法律规定，则可能合法；反之，则不合法。以下从不同角度进行分析：
一、劳动合同或规章制度有明确约定
合法情形：
- 如果工厂在劳动合同或规章制度中明确规定了满勤奖励和未达满勤的扣减底薪条款，并且这些条款不违反国家法律法规的强制性规定，那么工厂按照约定扣减底薪是合法的。
- 例如，劳动合同中约定：“员工每月需达到满勤标准，方可获得全额底薪；若未达满勤，则按实际出勤天数比例扣减底薪。”这样的约定是合法有效的。
注意事项：
- 工厂在制定规章制度或劳动合同条款时，必须确保内容合法、合理，并且已经向员工进行了充分的告知和解释。
- 规章制度或劳动合同条款不得违反国家法律法规的强制性规定，如最低工资标准、加班费支付等。
二、劳动合同或规章制度无明确约定
不合法情形：
- 如果工厂在劳动合同或规章制度中没有明确规定未达满勤扣减底薪的条款，那么工厂擅自扣减底薪是不合法的。
- 根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。未经劳动者同意，用人单位不得擅自变更劳动合同内容或扣减劳动报酬。
法律后果：
- 如果工厂擅自扣减底薪，劳动者有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，要求工厂补发被扣减的底薪，并可能获得相应的经济补偿。
三、特殊情况下的考虑
病假、事假等：
- 如果员工因病假、事假等合理原因未达满勤，工厂在扣减底薪时应当考虑这些因素，并按照国家规定和劳动合同约定进行处理。
- 例如，员工因病请假，工厂应当按照病假工资标准支付工资，而不是直接扣减底薪。
工厂经营困难：
- 如果工厂因经营困难需要裁员或降薪，应当与员工进行协商，并按照国家规定和劳动合同约定进行处理。
- 未经员工同意，工厂不得擅自扣减底薪或进行其他形式的降薪。
建议与总结
- 对员工：如果遇到工厂未达满勤扣底薪的情况，首先应当查看劳动合同和规章制度中是否有相关约定。如果没有约定或约定不合法，可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。
- 对工厂：在制定规章制度和劳动合同条款时，应当确保内容合法、合理，并且已经向员工进行了充分的告知和解释。同时，在处理未达满勤扣底薪等问题时，应当遵循国家法律法规和劳动合同约定，避免引发劳动争议。
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