结论：离职申请流程未走完，但员工明天仍正常上下班打卡的，工资是否发放取决于员工是否实际提供了劳动以及公司的规章制度，一般情况下，只要员工实际提供了劳动，公司就应当支付工资。
详细分析
劳动关系存续期间：
- 在离职申请流程未走完之前，员工与公司之间的劳动关系仍然存续。这意味着，员工仍然受公司规章制度的约束，同时也享有获得劳动报酬的权利。
实际提供劳动：
- 如果员工在离职申请流程未走完的情况下，仍然按照公司的要求正常上下班打卡，并实际提供了劳动，那么公司就应当按照劳动合同的约定或者国家规定支付工资。
- 工资是员工因提供劳动而获得的报酬，只要员工实际提供了劳动，无论离职申请流程是否走完，公司都应当支付相应的工资。
公司规章制度：
- 当然，公司也可能有内部的规章制度对离职流程中的工资支付进行规定。但是，这些规章制度必须符合国家法律法规的规定，不能侵犯员工的合法权益。
- 如果公司的规章制度违反了国家法律法规的规定，或者与劳动合同的约定相冲突，那么这些规章制度是无效的，公司仍然需要按照国家法律法规和劳动合同的约定支付工资。
特殊情况：
- 如果员工在离职申请流程未走完的情况下，未经公司同意擅自离职或者未按照公司的要求提供劳动，那么公司可能有权不支付或者少支付工资。但是，这种情况需要具体分析，并且公司需要提供充分的证据来证明员工存在擅自离职或者未提供劳动的行为。
建议
对于员工：
- 在离职申请流程未走完之前，仍然应当按照公司的要求正常上下班打卡，并实际提供劳动，以确保自己能够获得应得的工资。
- 如果公司拒绝支付工资或者存在其他违法行为，员工可以向当地的劳动监察部门投诉或者申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。
对于公司：
- 应当制定合法合规的规章制度，并明确离职流程中的工资支付规定。
- 在员工离职申请流程未走完的情况下，如果员工仍然实际提供了劳动，公司应当按照约定支付工资，避免引发劳动纠纷。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。