协商一致解除劳动关系后，在特定情形下仍然可以申请劳动仲裁。以下是对这一问题的详细分析：
一、法律依据
《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二条：明确规定了因订立、履行、变更、解除和终止劳动合同发生的争议属于劳动争议范畴。协商解除劳动合同作为劳动关系终止的特殊形式，若存在未兑现补偿金、未依法办理离职手续等纠纷，劳动者有权申请仲裁。
《中华人民共和国劳动合同法》第三十六条与第四十六条：第三十六条规定用人单位与劳动者可协商一致解除合同；第四十六条则明确了协商解除时用人单位需支付经济补偿的法定情形（如非劳动者主动提出）。若用人单位未按约定支付补偿金或存在其他违法操作，劳动者可通过仲裁主张权益。
二、具体适用情形
协议内容显失公平或存在欺诈胁迫：
- 如果用人单位以不支付补偿金为由胁迫劳动者签署解除协议，或者协议约定的补偿标准明显低于法定标准，劳动者可以依据《民法典》第一百四十八条撤销合同后申请仲裁。
用人单位未履行协议义务：
- 包括未按时足额支付经济补偿金、未出具离职证明、未办理社保转移手续等情形。在这些情况下，劳动者可以直接就协议履行问题提起仲裁。
协议违反法律强制性规定：
- 例如约定放弃工伤赔偿权利、排除劳动者追索加班工资权利等无效条款。在这些情况下，劳动者仍可主张相关法定权益。
后续发现新的事实证据：
- 如解除后发现用人单位存在拖欠工资、未缴纳社会保险等违法行为，即使已签署解除协议，劳动者仍可就原劳动关系存续期间的问题申请仲裁。
三、申请劳动仲裁的程序与注意事项
申请程序：
- 劳动者应在知道或应当知道其权利受侵害之日起一年内，向有管辖权的劳动争议仲裁委员会提交书面仲裁申请，并按照被申请人人数提交副本。
- 仲裁委员会在收到申请后，会进行审查和处理，组织双方进行调解或开庭审理，最终作出仲裁裁决。
注意事项：
- 劳动者在申请仲裁时，应提供充分证据支持自己的主张，如劳动合同、解除协议、工资单、社保缴纳记录等。
- 劳动者应积极配合仲裁过程，按时参加仲裁活动，遵守仲裁纪律。
四、法律后果与建议
法律后果：
- 如果仲裁裁决支持劳动者的主张，用人单位需履行裁决义务，如支付经济补偿金、补缴社会保险等。
- 如果用人单位不履行裁决义务，劳动者可以向人民法院申请强制执行。
建议：
- 在协商解除劳动关系时，劳动者应仔细阅读协议内容，确保自己的权益得到充分保障。
- 如果对协议内容有疑问或不确定，可以咨询专业律师或劳动仲裁机构，以获取更准确的法律意见。
- 在签署协议后，如果发现用人单位存在违法行为或未履行协议义务，应及时向劳动仲裁机构申请仲裁，以维护自己的合法权益。
综上所述，协商一致解除劳动关系后，在特定情形下劳动者仍然可以申请劳动仲裁。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。