关于执行金额在原告申请执行后剩余款退还是否有时效性的问题，结论如下：
剩余款退还本身无特定时效性限制：
- 在执行程序中，当执行金额超出被执行人应履行的债务、执行费用等后，剩余款项应当退还被执行人。这一退还行为本身并不受特定时效性的严格限制，而是基于执行程序的完成情况和法院的裁定。一旦执行法院确认执行完毕，并裁定终结执行程序，剩余款项即应按照裁定及时退还被执行人。
但需注意执行程序的整体时效性：
- 虽然剩余款退还无特定时效性，但执行程序本身是有时效性的。根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，申请执行的期间为二年。申请执行时效的中止、中断，适用法律有关诉讼时效中止、中断的规定。这意味着，如果原告在法定期限内未申请执行，可能会丧失申请执行的权利，进而影响剩余款的退还（因为若未进入执行程序，则无剩余款退还之说）。
退还流程与时间节点：
- 在执行过程中，法院会依法对被执行人的财产进行查封、扣押、冻结等措施，并依法进行拍卖、变卖等处置以清偿债务。当执行款项足够清偿债务及执行费用后，法院会及时解除对被执行人财产的查封、扣押、冻结等措施，并裁定终结执行程序。此时，如果仍有剩余款项，法院会按照裁定及时退还被执行人。这一过程的时间节点主要取决于执行程序的进展和法院的裁定。
特殊情况下的处理：
- 如果在执行过程中发现被执行人有其他财产可供执行，或者申请执行人发现被执行人有转移、隐匿财产等行为，可以及时向法院申请恢复执行或采取其他法律措施。这可能会影响剩余款的退还时间，但并不改变剩余款退还本身无特定时效性限制的事实。
法律建议：
- 对于原告而言，应及时在法定期限内申请执行，并关注执行程序的进展情况。如果执行过程中出现任何问题或需要延长执行期限的情况，应及时与法院沟通并办理相关手续。
- 对于被执行人而言，如果认为执行过程中存在违法行为或侵犯其合法权益的情况，可以依法向法院提出异议或申请复议。同时，也应积极配合法院的执行工作，以便尽快完成执行程序并退还剩余款项。
可能后果：
- 如果原告未在法定期限内申请执行，可能会丧失申请执行的权利，进而无法获得剩余款的退还。
- 如果被执行人拒不配合执行工作或存在转移、隐匿财产等行为，可能会面临更严厉的法律制裁，并影响剩余款的退还时间。