员工贪了5000元，一般情况下不能直接通过刑事途径起诉，但可以通过民事途径要求返还，并可能依据公司规章制度进行处分。以下从不同角度为您详细分析：
一、刑事途径分析
职务侵占罪的立案标准：
- 根据《最高人民检察院、公安部关于公安机关管辖的刑事案件立案追诉标准的规定(二)》第八十四条，公司、企业或者其他单位的人员，利用职务上的便利，将本单位财物非法占为己有，数额在五千元至一万元以上的，应予立案追诉。
- 这意味着，如果员工贪污的金额未达到五千元至一万元的立案标准（具体标准可能因地区而异，但5000元通常未达），则不能通过刑事途径追究其责任。
非国家工作人员受贿罪的立案标准：
- 对于非国家工作人员受贿，依据相关司法解释，受贿数额达到三万元以上，才会立案追诉。
- 因此，如果员工是以受贿形式贪污5000元，且非国家工作人员，同样不能通过刑事途径追究。
二、民事途径分析
要求返还财物：
- 无论员工是否构成刑事犯罪，企业都有权要求其返还贪污的财物。
- 企业可以通过民事诉讼的方式，向法院提起诉讼，要求员工返还贪污的款项。
收集证据：
- 在提起民事诉讼前，企业需要收集相关证据，如财务记录、转账凭证、证人证言等，以证明员工存在贪污行为及具体金额。
- 这些证据将有助于法院在审理案件时作出公正的判决。
三、公司规章制度处分
依据公司规章制度处理：
- 除了通过法律途径追究员工责任外，企业还可以依据公司规章制度对员工进行处分。
- 这可能包括警告、降职、辞退等纪律处分措施。
完善内部管理：
- 企业应完善内部监督和财务管理制度，防止类似情况再次发生。
- 通过加强员工培训、提高员工法律意识等方式，减少贪污行为的发生。
四、特殊情况说明
- 如果员工是国家工作人员：
- 在特定情形下，如多次受贿且未经处理、为他人谋取不正当利益导致公共财产、国家和人民利益受损等，受贿5000元也可能立案。
- 但这种情况较为特殊，需要具体分析员工的身份和受贿情节。
建议：
- 如果您是企业负责人或相关人员，发现员工贪污5000元后，首先应尝试通过内部途径解决，如要求员工返还财物、依据公司规章制度进行处分等。
- 如果内部途径无法解决问题，或者您认为员工的贪污行为已经严重损害了企业利益，可以考虑通过民事诉讼的方式追究其责任。
- 在整个过程中，务必注意收集相关证据，以便在需要时提供有力支持。
如有任何法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。