结论：公司设置部分提成为留岗奖金且半年后才发放，这一做法是否合规，需根据具体情况判断，但一般情况下，若未与员工明确约定且不符合相关法律规定，则可能不合规。
分析说明：
劳动合同与规章制度：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关规定，用人单位与劳动者应当遵循合法、公平、平等自愿、协商一致的原则订立劳动合同，劳动合同中应明确劳动报酬等条款。
- 若公司规章制度或劳动合同中明确规定了提成的发放方式和时间，且该规定不违反法律法规的强制性规定，那么公司按照约定执行是合法的。
- 若公司未与员工明确约定提成作为留岗奖金且半年后发放，而是单方面决定，则可能违反劳动合同的约定和法律法规的精神。
工资支付规定：
- 根据《中华人民共和国劳动法》和《工资支付暂行规定》，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。
- 提成作为劳动报酬的一部分，通常也应遵循按月支付的原则。若公司将提成作为留岗奖金且半年后才发放，可能构成无故拖欠工资，除非有合法合理的理由（如双方有特别约定、公司经营困难且经工会或职工代表大会同意等）。
留岗奖金的合法性：
- 留岗奖金若作为公司对员工的一种激励措施，其合法性和合理性取决于双方是否有明确约定以及该约定是否违反法律法规的强制性规定。
- 若留岗奖金的发放条件、时间和方式等未与员工明确约定，或者约定违反法律法规，则公司单方面决定半年后发放可能不合规。
法律建议：
对于员工：
- 首先查看劳动合同和公司规章制度中关于提成和留岗奖金的规定。
- 若公司未明确约定或规定违反法律法规，可与公司协商要求按时发放提成。
- 若协商无果，可向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
对于公司：
- 应确保劳动合同和规章制度中明确规定了提成的发放方式和时间，以及留岗奖金的相关条款。
- 若需变更提成发放方式或时间，应与员工协商一致并签订书面协议。
- 遵守相关法律法规，避免无故拖欠员工工资或违反其他劳动法律法规的规定。
可能后果：
- 若公司未按时发放提成且无法提供合法合理的理由，可能面临劳动监察部门的处罚和员工的劳动仲裁申请，需承担支付拖欠工资、经济补偿金等法律责任。
- 若员工因此与公司产生纠纷，可能影响公司的声誉和员工的工作积极性，对公司的长期发展不利。
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