公司若发现员工自行制作假的离职证明，通常会根据具体情况采取相应的处理措施，具体如下：

1. 解除劳动合同
   根据《劳动合同法》第三十九条，劳动者以欺诈手段使公司在违背真实意思的情况下订立或变更劳动合同的，公司有权单方解除劳动合同且无需支付经济补偿。例如，员工伪造离职证明以隐瞒竞业限制义务或虚构工作经历，公司可立即终止劳动关系。

2. 追偿经济损失
   若员工使用假证明导致公司遭受直接损失（如招聘成本、培训费用、项目延误赔偿等），公司可依据《民法典》第一千一百六十五条要求员工赔偿。例如，员工因伪造证明入职后无法胜任工作，导致公司客户流失，公司可主张赔偿实际损失。

3. 行业通报与信用惩戒
   公司可能将员工行为通报至行业协会或征信机构，影响其未来就业。部分行业（如金融、医疗）对从业人员诚信要求严格，此类记录可能导致员工在行业内难以立足。

4. 行政处罚与刑事追责（极端情况）
   若伪造证明涉及伪造国家机关公文（如冒用原单位公章），可能触犯《刑法》第二百八十条，面临三年以下有期徒刑、拘役、管制或剥夺政治权利。即使不构成犯罪，公司也可依据《治安管理处罚法》第五十二条向公安机关报案，追究行政责任。

对员工的建议：

• 若已提交假证明，应主动向公司坦白并协商补救措施，争取从轻处理；
  
• 若公司已启动调查，切勿销毁或篡改证据，否则可能加重法律责任；
  
• 未来求职时，可通过合法途径（如原单位出具书面说明）解决离职证明问题，避免侥幸心理。

对公司的建议：

• 发现假证明后，应固定证据（如原件比对、公证等），再启动内部调查程序；
  
• 处理时需符合《劳动合同法》规定的程序（如通知工会、出具书面解除通知等），避免程序违法；
  
• 可考虑在入职环节增加背景调查（如委托第三方机构核实工作经历），降低风险。

如有进一步疑问，可直接向我咨询具体场景下的应对策略。