部门绩效考核制度没有公司加盖公章，并不直接决定其合法性，但可能影响其证明力和执行力。以下从几个角度详细分析：

1. 制度合法性的基础：

   • 绩效考核制度作为公司内部管理规定，其合法性主要来源于是否符合法律法规的规定，如《劳动法》、《劳动合同法》等，以及是否经过民主程序制定（如职工代表大会或全体职工讨论、协商等），并公示或告知劳动者。
   • 加盖公章是公司对外表示认可的一种方式，但在公司内部管理制度上，并非所有文件都必须加盖公章才具有法律效力。关键在于制度的内容是否合法、合理，以及是否得到了员工的认可或知晓。

2. 未加盖公章的影响：

   • 证明力：如果绩效考核制度未加盖公章，在发生劳动争议时，可能难以直接作为证据使用，因为公章是公司身份和权威的象征，未加盖公章的文件可能被质疑其真实性和来源。
   • 执行力：未加盖公章的制度可能在执行上遇到困难，因为员工可能对其效力产生怀疑，从而不愿意遵守。此外，如果公司试图依据未加盖公章的制度对员工进行处罚或调整薪酬等，员工可能会提出异议。

3. 实际操作建议：

   • 完善制度制定程序：确保绩效考核制度经过民主程序制定，并公示或告知劳动者，以增强其合法性和执行力。
   • 加盖公章或签字确认：虽然并非所有内部管理制度都必须加盖公章，但为了增加其证明力和执行力，建议公司在制度上加盖公章或由相关负责人签字确认。
   • 保留证据：在制定和执行绩效考核制度时，公司应保留好相关证据，如会议记录、公示照片、员工签字确认等，以备不时之需。

4. 法律后果：

   • 如果绩效考核制度未加盖公章且未经过民主程序制定或未公示告知劳动者，那么在发生劳动争议时，该制度可能被认定为无效或部分无效，公司可能因此承担不利的法律后果。
   • 反之，如果制度内容合法、合理，且经过了民主程序制定并公示告知劳动者，即使未加盖公章，也可能被认定为有效，但公司仍需承担举证责任证明其合法性和执行力。

总结来说，部门绩效考核制度没有公司加盖公章并不直接决定其合法性，但可能影响其证明力和执行力。为了确保制度的合法性和有效性，建议公司在制定和执行绩效考核制度时遵循相关法律法规和民主程序，并考虑加盖公章或由相关负责人签字确认。如果你在劳动仲裁方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。