公司按照其制度进行考核，在符合法律法规要求的前提下是合法的。以下从多个角度为你详细分析：
一、考核制度合法性的基本要求
内容合法：
- 考核制度必须符合《中华人民共和国劳动法》《中华人民共和国劳动合同法》等相关法律法规的要求。
- 不得设置歧视性条款，如基于性别、年龄、民族等不公平因素进行考核。
程序合法：
- 考核制度的制定应经过民主程序，如通过职工代表大会或全体职工讨论，并与工会或职工代表平等协商确定。
- 制度应公示或告知劳动者，确保员工知晓并理解考核内容和标准。这是保障员工知情权的重要环节，也是考核制度合法性的基础。
二、考核制度的具体实施要点
明确考核指标与标准：
- 根据岗位说明书和工作职责，设定具体的考核指标和标准。
- 指标应可量化、可衡量，便于操作和评估。这有助于确保考核的客观性和准确性。
实施科学的考核方法：
- 选择合适的考核方法，如关键绩效指标（KPI）考核、360度反馈评价、目标管理（MBO）等。
- 按照既定的考核周期和流程进行考核，收集真实、准确的考核数据作为评价依据。
及时反馈与沟通：
- 考核结果应及时反馈给员工，指出优点和不足。
- 与员工进行面谈，听取员工意见，共同制定改进计划。这有助于增强员工对考核制度的认同感和参与感。
三、考核结果的合理运用
与薪酬挂钩：
- 根据考核结果调整员工薪酬，体现多劳多得、优绩优酬的原则。这有助于激励员工积极工作，提高工作效率和质量。
用于培训与发展：
- 针对员工不足提供培训和发展机会，帮助员工提升能力。这有助于促进员工的个人成长和职业发展。
作为晋升与调岗依据：
- 考核结果可作为员工晋升、调岗的重要参考。这有助于企业合理配置人力资源，实现人岗匹配。
四、建立申诉机制
- 设立申诉渠道：为员工提供申诉途径，如对考核结果有异议可提出申诉。
- 及时处理申诉：企业应认真对待员工申诉，及时调查处理并给予答复。这有助于维护员工的合法权益，增强员工对考核制度的信任感。
五、实际案例与风险提示
- 实际案例：假设某公司制定了一套详细的考核制度，并经过民主程序公示告知员工。在实施过程中，公司按照既定的考核周期和流程进行考核，及时反馈考核结果并与员工进行沟通。同时，公司将考核结果与薪酬、培训、晋升等挂钩，有效激励了员工的工作积极性。这样的考核制度就是合法的。
- 风险提示：如果公司的考核制度存在内容违法、程序不合法或实施不科学等问题，如设置歧视性条款、未公示告知员工、考核过程不透明等，就可能引发劳动纠纷，给公司带来不必要的法律风险和经济损失。
建议：公司在制定和实施考核制度时，应严格遵守相关法律法规的要求，确保考核制度的合法性和有效性。同时，公司应加强与员工的沟通和反馈机制建设，增强员工对考核制度的认同感和参与感。如果你在劳动工伤（劳动仲裁）方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。